基因總覽
ACRV1 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 acrosomal vesicle protein 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 11q24.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000533904 ★ | 125,671,522–125,680,847 | 4 |
| ENST00000315608 | 125,671,522–125,680,874 | 4 |
| ENST00000530048 | 125,671,522–125,680,874 | 5 |
| ENST00000527795 | 125,671,522–125,680,874 | 5 |
| ENST00001098503 | 125,671,522–125,680,874 | 3 |
| ENST00001144096 | 125,671,522–125,680,874 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>ACRV1 ENST00000533904 GRCh38 chr11:125680747-125681847 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAATCCTCCATAAGTTCTAGTTTTATATCAGGTGGATGCCTCACTGCATCCATCTTCTCAGCTTGGCCAC CCCCTTGCTACCAAGTTGCAGCTCAAAACGCAGCTTTCTACTGTCTCTTGATCTCTTTACTCTGCCCATA TCTGTGTAAACTCTCCTCAGTTACCCATTTGAGTTTGCCACCTGTTTCCTGCTAAAACCATGTTGATAAA GGTCTGTATGAAAAGACTATTTACAGAAGTGGGCAAGGTTAAGGAAACAAACAAACAAAAAAAGAGATAA GTTTGGGCATCCAGATTTTAGTAACAGCAGGAAACCATTATCATCCCTAGGCCTAAGAGGGCAGGGGGAG AAAAACATATTACCATAGCATGGATGAGAGCTGGAGCCATGGAAGAGAGGACACCCAACAGAAGCTCTGT CATGTAGACTCAGCCAGTGTCAACTGTGGCAGGAAGGGAATAGGAAGAACAAATATTCCAGTCTCGCTCT CTTTCTCCCCATTCCTCCCTTCCCTCTTCCTCTCTCTCTTTCTCTCTTCTCCCCTCCAATCCTGTATAAA CCCAATCTGAAGCCAAATCCAGCCAGCATTCAGGTGATAAAGTCAACAGAGGTCAACCTTCCAGGGTACA GATCAGAGCCAAGAAAGGCTGATTTAGAAAGCCAAACAGAAAACAATCAACAATTACATCTCATTGTCAA AAACACTTTTAAAAGACAGTAGATATCTTTTAAACTTTATTACAAAAAATATGTGCTTTTTGGTAATACT TTTTTTTTTTTTTTAAAGATAGGGCAGATAGCCCCAACACACTACCCTGCACACAGAAAATAATCATTGG TCTTCACTAGTGAAATAAGCAGTGGGTTGCTAAGGGCCAACTTGCCTGAACAGGCTACACAAGAACCTCA GAGCCCAACCCATTGTGAAGAAACATGGGTTACTTCTGAGGTTCTAGAATTCCCAGAAGCTCTGCTTCAG CACTGGAAGCTTTTGCTCGCAGTTTGCTTCATAGCTCTGTGAAGAAGCTGTGGCCCACACTGGGGTCCCC TCTTTTCCTAAATCCAGATGAACAGGTTTCTCTTGCTAATGAGTCTTTATC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ACRV1_1 ↗ | 11:125,680,847 | 負股 | 125,680,837–125,680,896 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:265 aa
acrosomal vesicle protein 1 長 265 個胺基酸,N 端第 1–21 位為訊號序列。第 62–181 位被註記為無序區域,其中包含多組短胺基酸重複序列;另有三類重複區段註記,分別位於第 66–95、85–168 及 110–174 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ACRV1 註記於細胞質囊泡、分泌囊泡及頂體;在高基氏體期精細胞中,亦見於新生頂體囊泡。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- CISD2Q8N5K1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PANK2Q9BZ23-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPT1P50897 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPRED1Q7Z699 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TSC1Q86WV8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | ACRV1 被註記位於細胞質囊泡、分泌囊泡與頂體;此外,在高基氏體期的精細胞中,ACRV1 也位於新生頂體囊泡。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, acrosome; Nascent acrosomal vesicle of Golgi phase spermatids |
核酸與蛋白質序列
AGTTTGCTTCATAGCTCTGTGAAGAAGCTGTGGCCCACAC40TGGGGTCCCCTCTTTTCCTAAATCCAGATGAACAGGTTTC80TCTTGCTAATGAGTCTTTATCTGCTTGGATCTGCCAGAGG120AACATCAAGTCAGCCTAATGAGCTTTCTGGCTCCATAGAT160CATCAAACTTCAGTTCAGCAACTTCCAGGTGAGTTCTTTT200CACTTGAAAACCCTTCTGATGCTGAGGCTTTATATGAGAC240TTCTTCAGGCCTGAACACTTTAAGTGAGCATGGTTCCAGT280GAGCATGGTTCAAGCAAGCACACTGTGGCCGAGCACACTT320CTGGAGAACATGCTGAGAGTGAGCATGCTTCAGGTGAGCC360CGCTGCGACTGAACATGCTGAAGGTGAGCATACTGTAGGT400GAGCAGCCTTCAGGAGAACAGCCTTCAGGTGAACACCTCT440CCGGAGAACAGCCTTTGAGTGAGCTTGAGTCAGGTGAACA480GCCTTCAGATGAACAGCCTTCAGGTGAACATGGCTCCGGT520GAACAGCCTTCTGGTGAGCAGGCCTCGGGTGAACAGCCTT560CAGGTGAGCACGCTTCAGGGGAACAGGCTTCAGGTGCACC600AATTTCAAGCACATCTACAGGCACAATATTAAATTGCTAC640ACATGTGCTTATATGAATGATCAAGGAAAATGTCTTCGTG680GAGAGGGAACCTGCATCACTCAGAATTCCCAGCAGTGCAT720GTTAAAGAAGATCTTTGAAGGTGGAAAACTCCAATTCATG760GTTCAAGGGTGTGAGAACATGTGCCCATCTATGAACCTCT800TCTCCCATGGAACGAGGATGCAAATTATATGCTGTCGAAA840TCAATCTTTCTGCAATAAGATCTAGAAGCCTGGGCCCTTG880CTTGTTTTGACTCAGGCAGTAAAAAGCCTCCATCACTCTA920TTTGGCTCATTTTATATTTAGTTCCTTCCCCAGTCAACAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。