演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ACP4ACPT

acid phosphatase 4

ACP4 是蛋白質編碼基因,產物 acid phosphatase 4 具有蛋白質酪胺酸磷酸酶功能,並參與牙齒生成。

Homo sapiens19q13.33UniProt Q9BZG2
OFFICIAL SYMBOL
ACP4
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9BZG2
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ACP4 是位於人類第 19 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 acid phosphatase 4。其產物具有蛋白質酪胺酸磷酸酶活性,並具有胞外催化區域。來源亦指出,該蛋白參與牙齒生成;其作用包括調節成牙本質細胞的命運。關於細胞增殖與分化的描述標示為依相似性推論,不能視為已直接證實。

Official symbol
ACP4
Gene name
acid phosphatase 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14376
UniProt
Q9BZG2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ACPT

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.33
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ACP4pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:50,790,415–50,795,219
Gene span
4,805 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000270593 ★50,790,415–50,795,21911

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

acid phosphatase 4 是一種蛋白質酪胺酸磷酸酶,可使受體酪胺酸蛋白激酶 ERBB4 去磷酸化。這項作用會抑制由配體誘導的 ERBB4 蛋白水解切割,來源並未在此進一步描述其下游結果。

ACP4 也參與牙齒生成。來源指出,其胞外催化區域與成牙本質細胞命運調節有關;依相似性推論,這種調節可能透過抑制細胞增殖並促進分化來進行。此細胞命運調節描述帶有「依相似性」的證據限定,應保留其推論性質。

其酵素反應是將蛋白質上的 O-磷酸-L-酪胺酸轉換為 L-酪胺酸並釋出磷酸。這與其作為蛋白質酪胺酸磷酸酶的功能相符;不過,來源提供的具體受質例子為 ERBB4,未支持將作用範圍延伸至其他受質。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 50790415 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ACP4 ENST00000270593 GRCh38 chr19:50789415-50790515 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGTCGCGTGTGTCTGTAATCCCAGCTACTAGGGGGGCTGAGGCAGGAGGATCGCTTGAACCTGGGAGGT
GGAGGTTGCAGCAAGCTGAGACTGTGTCACTGCACTCCAGCCTGGGAAACAGAGTAAGACTACATCTCAA
AAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAGAAAAAAGAAAGAAAGGAAGATGACTTGTTATACTCACAGCTTCC
CCAGAGGAGGGGGCATGCCACAGGGGCCACATGGGGACGCACCAATGGTGCCCAGGAGGTAGACCACGAG
CAAGCGGCTTCCTTGTGTTTTCTGTGGGATAAGGTAGGGTAAAGAGTGGCTGGTTGCGCCATTTCAGCAG
GCTCTGGGGCACAGGGGCTGTCCTGAGTTGTCCGATACCCTGCCCCGGGTGATCAGGGCAGGTGGATGGT
GGCCTGGGTGGTGGGTTGGCTGGTTTGTACAGGAGAGGCATGCGCTTGGGCCAGTCCCTGACTATCTCCA
GGAACTGGTAACCCTGGGAGGGGTGGTCCTTCTACGATCAGCAAGGCCCCTGATGTCAAAGCATCAGAGT
ACAGAAAATCAAGCACATAGTTACTATCGTCAGCCTCTGCAACTCAGGGGGTCAAGACTGTTGCTGAGAC
GAACAATGTGGGGTGGGGGTCTCTGTCCAAGTCTGCAACCAGGTTAAAGGCACCTGTGTTCAAATCGCAG
CTTTGTCTGAGAAATCTGTGTTTTCTCAGGCCAGTTAGGGAACCCTTCTGTGCCTCAGTTTCCCCATCGG
TACAATGGGGATGGTGGTAAGCACATCAGTGTCTCCTGGGGCAGCGATGAAGATGAAACGAAGATGAAAC
GGGTTAATCCAAGGCTGGCAGAGGCGCTGGGGAATGGGATCTGTGGCCCCTGGGGGAGCGTGCCAGGGCC
TGCTATAATGGGGGTGCTGAGTGCAGGGCTGGGACAGGCGGGGCTGCGGCCCAGACAGTGGGCTGAGCTC
AGCGTCTGGGCTGGGTGGAAATGGCCGGCCTGGGGTTTTGGGGCCACCCTGCTGGACCTCTCCTGCTGCT
GCTGCTGCTGGTGCTGCCACCCCGGGCCCTGCCAGAAGGACCCCTGGTGTT
ACP4 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_83HBM5 · enhancer · 50791245–50791392 · regulatory

ENSR19_83HBN7 · promoter · 50793132–50793270 · regulatory

ENSR19_9Q6C6 · enhancer · 50793283–50793573 · regulatory

ENSR19_9Q6C9 · promoter · 50793574–50794074 · regulatory

· motif · 50790022–50790029 · motif

· motif · 50790719–50790732 · motif

· motif · 50790872–50790879 · motif

· motif · 50790883–50790898 · motif

· motif · 50790885–50790898 · motif

· motif · 50790888–50790900 · motif

· motif · 50790891–50790898 · motif

· motif · 50790892–50790905 · motif

· motif · 50790899–50790912 · motif

· motif · 50790902–50790914 · motif

· motif · 50790941–50790954 · motif

· motif · 50790948–50790961 · motif

· motif · 50790951–50790963 · motif

· motif · 50790954–50790961 · motif

· motif · 50790988–50791001 · motif

· motif · 50790994–50791001 · motif

· motif · 50791024–50791037 · motif

· motif · 50791027–50791039 · motif

· motif · 50791030–50791037 · motif

· motif · 50791048–50791063 · motif

· motif · 50791056–50791070 · motif

· motif · 50791057–50791070 · motif

· motif · 50791060–50791072 · motif

· motif · 50791063–50791070 · motif

· motif · 50791134–50791147 · motif

· motif · 50791141–50791154 · motif

· motif · 50791147–50791161 · motif

· motif · 50791148–50791161 · motif

· motif · 50791151–50791163 · motif

· motif · 50791154–50791161 · motif

· motif · 50791171–50791186 · motif

· motif · 50791172–50791186 · motif

· motif · 50791173–50791186 · motif

· motif · 50791176–50791188 · motif

· motif · 50791179–50791186 · motif

· motif · 50791199–50791214 · motif

· motif · 50791204–50791216 · motif

· motif · 50791207–50791214 · motif

· motif · 50791208–50791221 · motif

· motif · 50791215–50791228 · motif

· motif · 50791326–50791341 · motif

· motif · 50791328–50791341 · motif

· motif · 50791365–50791377 · motif

· motif · 50791368–50791375 · motif

· motif · 50791369–50791382 · motif

· motif · 50791411–50791418 · motif

· motif · 50791430–50791437 · motif

· motif · 50791492–50791506 · motif

· motif · 50791492–50791507 · motif

· motif · 50791501–50791514 · motif

· motif · 50791551–50791558 · motif

· motif · 50791597–50791609 · motif

· motif · 50791600–50791607 · motif

· motif · 50791600–50791614 · motif

· motif · 50791601–50791614 · motif

· motif · 50791670–50791685 · motif

· motif · 50793292–50793304 · motif

· motif · 50793294–50793301 · motif

· motif · 50794446–50794455 · motif

· motif · 50794512–50794522 · motif

· motif · 50794543–50794554 · motif

· motif · 50794545–50794554 · motif

· motif · 50794551–50794560 · motif

· motif · 50794551–50794564 · motif

· motif · 50794562–50794573 · motif

· motif · 50794910–50794921 · motif

· motif · 50795358–50795370 · motif

ACP4 表現受類固醇激素相關處理影響:合成雄激素 mibolerone 與 dihydrotestosterone(DHT)會上調其表現;estrogen 與 progestin 則會下調其表現。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:426 aa

1 aa426 aa訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q9BZG2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

acid phosphatase 4 長 426 個胺基酸,屬於 histidine acid phosphatase 家族。其 N 端訊號區位於第 1–26 位胺基酸,胞外區域為第 27–393 位;第 394–414 位為螺旋型跨膜區,第 415–426 位則為細胞質區域。

訊號胜肽1–26 aa
拓樸區域Extracellular27–393 aa
跨膜區Helical394–414 aa
拓樸區域Cytoplasmic415–426 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9BZG2…

AlphaFold · Q9BZG2

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

acid phosphatase 4 是單次穿膜的 I 型膜蛋白。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ACPTACP4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

acid phosphatase 4 形成同源二聚體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ACP4 的變異與常染色體隱性遺傳的 amelogenesis imperfecta 1J(AI1J)相關。此病屬於琺瑯質形成缺陷,可呈現琺瑯質發育不全、礦化不足或兩者並存;AI1J 的描述包括琺瑯質發育不全、顏色由黃色至黑色不等,而牙本質正常。來源將此疾病歸因於影響 ACP4 的變異。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能acid phosphatase 4 是蛋白質酪胺酸磷酸酶,可使受體酪胺酸蛋白激酶 ERBB4 去磷酸化,並抑制配體誘導的蛋白水解切割。此蛋白也參與牙齒生成;依相似性推論,其胞外催化區域可能藉由抑制增殖、促進分化來調節成牙本質細胞命運。含實驗來源
證據與來源

Protein tyrosine phosphatase that dephosphorylates the receptor tyrosine-protein kinase ERBB4, thereby inhibiting its ligand-induced proteolytic cleavage. Involved in odontogenesis. Regulates odontoblast cell fate via its extracellular catalytic domain by inhibiting proliferation and promoting differentiation (By similarity)

PMID 15219672 ↗ · PMID 27843125 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + H2O = L-tyrosyl-[protein] + phosphate含實驗來源
證據與來源

O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + H2O = L-tyrosyl-[protein] + phosphate

PMID 15219672 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homodimer推論支持
證據與來源

Homodimer

PMID 15219672 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位acid phosphatase 4 位於膜上,屬於單次穿膜的 I 型膜蛋白。推論支持
證據與來源

Membrane / Single-pass type I membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

調控mibolerone(一種合成雄激素)與 dihydrotestosterone(DHT)會上調 ACP4;estrogen 與 progestin 則會下調 ACP4。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated by mibolerone (a synthetic androgen) and dihydrotestosterone (DHT) and is down-regulated by estrogen and progestin

PMID 11414767 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 ACP4 的變異與 amelogenesis imperfecta 1J(AI1J)相關,該病為常染色體隱性遺傳。AI1J 可造成琺瑯質發育不全、顏色由黃色至黑色不等,牙本質正常;琺瑯質缺陷可表現為發育不全、礦化不足或兩者並存,牙齒也可能變色、敏感或容易崩解。含實驗來源
證據與來源

Amelogenesis imperfecta 1J AI1J A form of amelogenesis imperfecta, a disorder characterized by defective enamel formation. The enamel may be hypoplastic, hypomineralized or both, and affected teeth may be discolored, sensitive or prone to disintegration. AI1J is an autosomal recessive form characterized by hypoplastic enamel, enamel discolorization ranging from yellow to black, and normal dentin. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617297

PMID 27843125 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000270593 · 1,342 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ATGGCCGGCCTGGGGTTTTGGGGCCACCCTGCTGGACCTC40
41TCCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGCTGCCACCCCGGGCCCT80
81GCCAGAAGGACCCCTGGTGTTCGTGGCTCTGGTATTCCGC120
121CATGGCGACCGGGCCCCGCTGGCCTCCTACCCCATGGACC160
161CACACAAGGAGGTGGCCTCCACCCTGTGGCCACGAGGCCT200
201GGGCCAGCTGACCACGGAGGGGGTCCGCCAGCAGCTGGAG240
241CTGGGCCGCTTCCTGAGGAGCCGCTACGAGGCCTTCCTGA280
281GTCCGGAGTACCGGCGGGAGGAGGTGTACATCCGCAGCAC320
321GGACTTTGACCGCACGCTGGAGAGTGCCCAGGCCAACCTT360
361GCCGGGCTGTTTCCCGAGGCTGCTCCAGGGAGCCCCGAGG400
401CCCGCTGGAGGCCGATCCCGGTGCACACGGTGCCCGTGGC440
441TGAGGATAAGCTGCTGAGGTTCCCCATGCGCAGCTGTCCC480
481CGATACCACGAGCTGCTGCGGGAGGCCACCGAGGCCGCCG520
521AGTACCAGGAGGCCCTGGAGGGCTGGACGGGCTTCCTGAG560
561TCGCCTGGAGAACTTCACGGGACTGTCGCTGGTTGGAGAG600
601CCACTGCGCAGGGCATGGAAGGTTCTGGACACCCTCATGT640
641GCCAGCAAGCCCACGGTCTTCCACTACCAGCCTGGGCCTC680
681CCCAGATGTCCTGCGGACTCTTGCCCAGATCTCGGCTTTG720
721GATATTGGAGCCCACGTGGGCCCACCCCGGGCAGCAGAGA760
761AGGCCCAGCTGACAGGGGGGATCCTGCTGAATGCTATCCT800
801TGCAAACTTCTCCCGGGTCCAGCGCCTGGGGCTGCCCCTC840
841AAGATGGTCATGTACTCAGCTCATGACAGCACCCTGCTGG880
881CCCTCCAGGGGGCCCTGGGCCTCTATGATGGACACACCCC920
921GCCATATGCTGCCTGCCTCGGCTTTGAGTTCCGGAAGCAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。