基因總覽
ACP3 是蛋白質編碼基因,產物為 acid phosphatase 3,屬於 histidine acid phosphatase 家族。此蛋白具有酸性磷酸酶活性,可作用於多類磷酸單酯及磷酸化蛋白;來源也記載其脂質磷酸酶與核苷酸相關活性。不同異構型的細胞分布並不相同:Isoform 1 為分泌型,Isoform 2 則有跨膜形式,並可出現在細胞膜與細胞內位置。其序列註解包含訊號序列、與 PAPf39 纖維形成有關的區段,以及跨膜螺旋與細胞質拓樸區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000336375 ★ | 132,317,407–132,358,841 | 10 |
| ENST00000475741 | 132,317,364–132,357,007 | 9 |
| ENST00000351273 | 132,317,364–132,369,035 | 11 |
| ENST00001039565 | 132,317,364–132,369,035 | 10 |
| ENST00001142544 | 132,317,364–132,358,841 | 10 |
| ENST00000495911 | 132,317,369–132,342,579 | 5 |
| ENST00000507647 | 132,352,802–132,358,720 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
acid phosphatase 3 是非專一性酪胺酸磷酸酶,在酸性條件下(pH 4–6)可去磷酸化多種底物,包括烷基、芳基與醯基正磷酸單酯,以及磷酸化蛋白。其磷酸單酯水解反應會以水作為反應物,產生醇與磷酸;對蛋白質上的磷酸化酪胺酸,則可去除磷酸基,生成酪胺酸與磷酸。來源亦記載其具有脂質磷酸酶活性,可使精液中的 lysophosphatidic acid 失活。
在前列腺癌相關功能中,ACP3 被描述為腫瘤抑制因子:它透過去磷酸化 ERBB2,使 MAPK 介導的訊號失活。這項作用將 ACP3 的磷酸酶活性連結至細胞訊號調節與腫瘤抑制,但來源未提供更廣泛的適用情境。
此外,ACP3 在背根神經節(DRG)神經元中具有 ecto-5'-nucleotidase 活性,可將 AMP 轉為 adenosine;依序列相似性推定,生成的 adenosine 可抑制疼痛。此項描述屬於相似性推論,並非來源所述的直接實驗確認。
在精液中,ACP3 可形成稱為 SEVI(semen-derived enhancer of viral infection)的 β-sheet 澱粉樣纖維。這些纖維能捕捉 HIV 病毒粒子、促進其附著於目標細胞,並增強感染;來源也記載其可類似地增強 XMRV 感染。EGCG 可降解 SEVI 纖維;非天然六胜肽抑制劑 WW61 可抑制纖維組裝及其對 HIV 感染的增強作用,而 surfen 則可抑制病毒附著與感染增強。
Promoter 與基因調控
>ACP3 ENST00000336375 GRCh38 chr3:132316407-132317507 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGGCTAATTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTTAA CTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGAGCCACCACG CCCAGCCTAAAATTTTTCAAAATAAACTTGCTGTTACTTTTCTTCTTTAATTTAAAAATACCTCTATAGG CTACATGAGAGTTTTTGAAAAAGTAGCCATGTTTGGCATGGAAATAGGCCCCAAATATGTCAACACCTGT ATTTCCTTCCAGATTTCAGTCCTATAACTTTGGACTCCCAACAGATTAAGAATCACTGGTCTAAGGTTTC TAAAGTCAGGGTAGATCCCTTTCCCAAGTGACAGCCACAAATCCAACGCTGTATCATACCCTATCTAAAG AAAAGATAAAAGTAAACTGGCTTGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGG CAGGCGGATCATGCGGTTAGGAGTTGGAGACCAGCCTAACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAA ATACAAAAATTCGCCGGGTGTGGTGGTGCACGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGACTGAAGCAGGAG AATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGTGCTCCAGCCTGGATGA CAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAGATAAAAGTAAACTGAAAACAAGGATA GAAATGTCTGCTAACATGCTCTGTGACCTTGATCAACAGCTTTCCCCGCTCTTGGCCTTGGTGTCCTAAC TTAAATGGGGAAACTGTGATCTCTCTCAGCTCAAAATTTACATGACATTATTTACATACCAAACCTGCCC TACGCTTCCTGGAAACTTTACTACTTATGAGTGTGGCTCCTCCTTCCCTTTCAATCCCTTAATTAAATAG CTTCCCCTCTACAGGCTTTTGAAGTGGTAGCAGTTCCTCCTAACTCCTGCCAGAAACAGCTCTCCTCAAC ATGAGAGCTGCACCCCTCCTCCTGGCCAGGGCAGCAAGCCTTAGCCTTGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ACPP_1 ↗ | 3:132,317,407 | 正股 | 132,317,358–132,317,417 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_93XJ28 · promoter · 132317112–132317417 · regulatory
ENSR3_93XJ2M · enhancer · 132318526–132318808 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:386 aa
acid phosphatase 3 屬於 histidine acid phosphatase 家族。序列註解列有位於第 1–32 位的訊號序列,以及第 260–265 位、與 PAPf39 纖維形成有關的區段;另註記第 382–404 位為螺旋型跨膜區,第 405–418 位為細胞質拓樸區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Isoform 1 為分泌型。 Isoform 2 可在細胞膜與溶酶體膜呈單次跨膜型態,也見於細胞核及細胞質;其似乎會在細胞膜與細胞內囊泡之間移動。 Isoform 2 與 FLOT1 在細胞膜及細胞內囊泡共定位,並與 LAMP2 在溶酶體膜共定位。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- ERBB2P04626 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
acid phosphatase 3 可形成同源二聚體,且二聚體形成是其磷酸酶活性所必需。來源未提供其他實體結合或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 10 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ACP3 是非專一性酪胺酸磷酸酶,可在 pH 4–6 的酸性條件下去磷酸化多種底物,包括烷基、芳基與醯基正磷酸單酯及磷酸化蛋白。它也具有脂質磷酸酶活性,可使精液中的 lysophosphatidic acid 失活。 | 含實驗來源 | 證據與來源A non-specific tyrosine phosphatase that dephosphorylates a diverse number of substrates under acidic conditions (pH 4-6) including alkyl, aryl, and acyl orthophosphate monoesters and phosphorylated proteins. Has lipid phosphatase activity and inactivates lysophosphatidic acid in seminal plasma PMID 10506173 ↗ · PMID 15280042 ↗ · PMID 20498373 ↗ · PMID 8132635 ↗ · PMID 9584846 ↗ |
| 功能 | ACP3 可藉由去磷酸化 ERBB2,使 MAPK 介導的訊號失活,並被描述為前列腺癌的腫瘤抑制因子。此外,它在背根神經節神經元中具有 ecto-5'-nucleotidase 活性,可由 AMP 生成 adenosine;此物質抑制疼痛的描述依據序列相似性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Tyrosine phosphatase that acts as a tumor suppressor of prostate cancer through dephosphorylation of ERBB2 and deactivation of MAPK-mediated signaling. In addition to its tyrosine phosphatase activity has ecto-5'-nucleotidase activity in dorsal root ganglion (DRG) neurons. Generates adenosine from AMP which acts as a pain suppressor (By similarity) PMID 20498373 ↗ |
| 功能 | 在精液中,ACP3 可形成 SEVI 澱粉樣纖維,捕捉 HIV 病毒粒子並促進其附著目標細胞、增強感染;也可類似地增強 XMRV 感染。EGCG 可降解纖維,WW61 可抑制纖維組裝及其增強 HIV 感染的作用,surfen 則可抑制病毒附著與感染增強。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Forms amyloid beta-sheet fibrils in semen. These fibrils, termed SEVI (semen-derived enhancer of viral infection) capture HIV virions, attach them to target cells and enhance infection. SEVI amyloid fibrils are degraded by polyphenol epigallocatechin-3-gallate (EGCG), a constituent of green tea. Assembly of SEVI amyloid fibrils and their amplification of HIV infection is inhibited by WW61, a non-natural hexapeptide inhibitor (Trp-His-Lys-chAla-Trp-hydroxyTic). The target cell attachment and enhancement of HIV infection is also inhibited by surfen. Also similarly boosts XMRV (xenotropic murine leukemia virus-related virus) infection PMID 18083097 ↗ · PMID 19403677 ↗ · PMID 19451623 ↗ · PMID 19897482 ↗ · PMID 21677644 ↗ |
| 分子活性 | a phosphate monoester + H2O = an alcohol + phosphate | 含實驗來源 | 證據與來源a phosphate monoester + H2O = an alcohol + phosphate PMID 10506173 ↗ · PMID 15280042 ↗ · PMID 8132635 ↗ · PMID 9584846 ↗ |
| 分子活性 | 1-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycero-3-phosphate + H2O = 1-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycerol + phosphate | 含實驗來源 | 證據與來源1-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycero-3-phosphate + H2O = 1-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycerol + phosphate PMID 10506173 ↗ |
| 分子活性 | a ribonucleoside 5'-phosphate + H2O = a ribonucleoside + phosphate | 推論支持 | |
| 分子活性 | O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + H2O = L-tyrosyl-[protein] + phosphate | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | ACP3 形成同源二聚體,而二聚體的形成是其磷酸酶活性所必需。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer; dimer formation is required for phosphatase activity PMID 10639192 ↗ · PMID 12525165 ↗ · PMID 38341922 ↗ · PMID 9804805 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 1; Secreted | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Isoform 2 可位於細胞膜、溶酶體膜、細胞核與細胞質,並似乎在細胞膜及細胞內囊泡間移動。它與 FLOT1 在細胞膜和細胞內囊泡共定位,並與 LAMP2 在溶酶體膜共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Isoform 2; Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Lysosome membrane / Single-pass type I membrane protein; Nucleus; Cytoplasm, cytosol; Appears to shuttle between the cell membrane and intracellular vesicles. Colocalizes with FLOT1 at cell membrane and in intracellular vesicles. Colocalizes with LAMP2 on the lysosome membrane PMID 17638863 ↗ · PMID 17897319 ↗ · PMID 20498373 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GAAGTGGTAGCAGTTCCTCCTAACTCCTGCCAGAAACAGC40TCTCCTCAACATGAGAGCTGCACCCCTCCTCCTGGCCAGG80GCAGCAAGCCTTAGCCTTGGCTTCTTGTTTCTGCTTTTTT120TCTGGCTAGACCGAAGTGTACTAGCCAAGGAGTTGAAGTT160TGTGACTTTGGTGTTTCGGCATGGAGACCGAAGTCCCATT200GACACCTTTCCCACTGACCCCATAAAGGAATCCTCATGGC240CACAAGGATTTGGCCAACTCACCCAGCTGGGCATGGAGCA280GCATTATGAACTTGGAGAGTATATAAGAAAGAGATATAGA320AAATTCTTGAATGAGTCCTATAAACATGAACAGGTTTATA360TTCGAAGCACAGACGTTGACCGGACTTTGATGAGTGCTAT400GACAAACCTGGCAGCCCTGTTTCCCCCAGAAGGTGTCAGC440ATCTGGAATCCTATCCTACTCTGGCAGCCCATCCCGGTGC480ACACAGTTCCTCTTTCTGAAGATCAGTTGCTATACCTGCC520TTTCAGGAACTGCCCTCGTTTTCAAGAACTTGAGAGTGAG560ACTTTGAAATCAGAGGAATTCCAGAAGAGGCTGCACCCTT600ATAAGGATTTTATAGCTACCTTGGGAAAACTTTCAGGATT640ACATGGCCAGGACCTTTTTGGAATTTGGAGTAAAGTCTAC680GACCCTTTATATTGTGAGAGTGTTCACAATTTCACTTTAC720CCTCCTGGGCCACTGAGGACACCATGACTAAGTTGAGAGA760ATTGTCAGAATTGTCCCTCCTGTCCCTCTATGGAATTCAC800AAGCAGAAAGAGAAATCTAGGCTCCAAGGGGGTGTCCTGG840TCAATGAAATCCTCAATCACATGAAGAGAGCAACTCAGAT880ACCAAGCTACAAAAAACTCATCATGTATTCTGCGCATGAC920ACTACTGTGAGTGGCCTACAGATGGCGCTAGATGTTTACA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。