基因總覽
ACP1 是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,正式名稱為 acid phosphatase 1,屬於 Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family。現有資料將其描述為可作用於酪胺酸磷酸化蛋白、低分子量芳基磷酸酯,以及天然與合成的醯基磷酸酯;不同異構型的底物專一性有所差異。另有資料記載其不具磷酸酶活性,但未提供可釐清此敘述與其他功能註記之間差異的條件或背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000272065 ★ | 264,947–278,283 | 6 |
| ENST00000407983 | 264,876–272,557 | 3 |
| ENST00000439645 | 264,876–272,630 | 3 |
| ENST00000405233 | 264,876–273,155 | 4 |
| ENST00000272067 | 264,876–280,057 | 6 |
| ENST00000896686 | 264,876–280,057 | 5 |
| ENST00000896687 | 264,876–280,057 | 4 |
| ENST00000896688 | 264,876–280,057 | 5 |
| ENST00000896689 | 264,876–280,057 | 3 |
| ENST00000896690 | 264,876–280,057 | 6 |
| ENST00000896691 | 264,876–280,057 | 5 |
| ENST00000972067 | 264,876–280,057 | 4 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ACP1 的資料記載包含兩種不同描述:一方面,其可作用於酪胺酸磷酸化蛋白、低分子量芳基磷酸酯,以及天然與合成的醯基磷酸酯;另一方面,另有註記指出它不具磷酸酶活性。來源未提供足以判定這些描述如何相互適用的條件,因此不宜將兩者合併成單一、無保留的功能結論。
所列反應式描述磷酸單酯與水反應,產生醇與磷酸;另列出酪胺酸磷酸化蛋白在水解後形成酪胺酸蛋白與磷酸。資料並指出,isoform 1 與 isoform 2 的底物專一性不同,但沒有進一步說明各自偏好的底物或差異方向。
在蛋白質關係方面,ACP1 與 EPHA2 及 EPHB1 有互作記錄;其中對 EPHA2 的資料另指出 ACP1 可使其去磷酸化。這提供了 ACP1 與受體蛋白磷酸化狀態相關的具體例子,但來源沒有說明其影響的生物學結果。整體而言,現有資訊支持其與多類含磷酸基底物及特定蛋白質的關聯,惟對作用條件與功能後果的描述有限。
Promoter 與基因調控
>ACP1 ENST00000272065 GRCh38 chr2:263947-265047 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGGGTGCTGCCGGACAGGTGGGTCCCCGGGTACTCACTGCTGCCCGCCCGGCCGCGGCGCCCCGTCCCGA GGCTGCCCAGGAAGAGGAAGGCGCGCTGCCCCGCCCCGCGGACAAGGAGGCCCCAGCGAGGGCGTACCTG CGGCAGGTGACGAAGGAGGCGGCGCAAAACACCCGCCGTGTACGTTTCGCGGGACAAAAACCACGCGCCC GCCGGGCCGCGCTCAGGCCTTCGCCCTCAGGGACTTCGGAACCGCCCCGTCCTCAAGATCGAAAAGCCCA GAGCCCCGCGGCGGCTCCAAGCACGGTGTTGGGGGTGGGGGTCTCAGGGAGCGCCCAGGCCCAAGGCCGC CCTGGTCCGGCGTGGACCCCGCGGGGCTCAAGGCAGGTTCCCCGCGTGACCCGCCCAGCCCCTCTATGCG AACTCGAACGACAGGCACCACAGCCCGCCACGTGCGCGAGACTCGCGCTGTGCCCCAACCCAGGTGGGCG GCCCGCGGAGCCGCGAGGCCTGAGCCCGCCCTGCAGGTGACCCGCGGCCCTTCCTCCTCCAGGTACCCCT CTCCTGCGGCCCCGTCCCCTATAGGTAACCTTTACCTCCCGCGGCTCCTTCCCCTCCAAGCGACCCGCAG CCCCGCCCCCTCCAGGTGACTCCCCCCCGCCAACCCCCGCCACCACACACACACACCCCCTCGCCTTCCG CGGCCCTACTCCCTCCAGGTGACCCCACCCCCGCAGCTCCTCCTCCTCCGGACAACCTGCAGCCCCGCCC CTGCAGGTGAACGGCGGCCCAGTCCCTGCAGGTGACCCGCGGACCCTCCCCGCCCGTCCTACTACCGTCA TAGGACCGCCTCCGCAGGCGCACTGGAGCCGATTGCGCAGGCGTGGCTCTCACACGCGCTGCCCTGTTGG CGTTGGTGCGGGACTGCGCAGGCGCGCGGGGCAAGAGGGTGGCAGTGCGCCTGCGCCGCGTCGGCGTGCG GAACGCCGCGGTGTCTCGGCGCCTCTGCGCGCGGGAAGATGGCGGAACAGGCTACCAAGTCCGTGCTGTT TGTGTGTCTGGGTAAGAGGGCGCCGACTTACTCATGTTCTGACGTCCTCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ACP1_1 ↗ | 2:264,947 | 正股 | 264,898–264,957 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_94RH · enhancer · 260747–261084 · regulatory
ENSR2_B3F5 · enhancer · 263129–264021 · regulatory
ENSR2_B3F8 · promoter · 264022–264669 · regulatory
ENSR2_53NCX · CTCF_binding_site · 264576–264597 · regulatory
ENSR2_87N9 · promoter · 264800–264957 · regulatory
ENSR2_B3FD · enhancer · 264958–265903 · regulatory
· motif · 259981–259992 · motif
· motif · 260129–260138 · motif
· motif · 260129–260138 · motif
· motif · 260406–260420 · motif
· motif · 260406–260420 · motif
· motif · 260788–260803 · motif
· motif · 260789–260803 · motif
· motif · 260882–260895 · motif
· motif · 260882–260895 · motif
· motif · 263845–263862 · motif
· motif · 263847–263862 · motif
· motif · 263854–263862 · motif
· motif · 263871–263886 · motif
· motif · 264372–264389 · motif
· motif · 264381–264396 · motif
· motif · 264425–264434 · motif
· motif · 264578–264591 · motif
· motif · 264578–264594 · motif
· motif · 264628–264641 · motif
· motif · 264670–264683 · motif
· motif · 264710–264723 · motif
· motif · 264791–264804 · motif
· motif · 264797–264808 · motif
· motif · 264797–264808 · motif
· motif · 264820–264831 · motif
· motif · 264820–264831 · motif
· motif · 264855–264871 · motif
· motif · 264871–264882 · motif
· motif · 264871–264882 · motif
· motif · 264902–264913 · motif
· motif · 264902–264913 · motif
· motif · 264911–264924 · motif
· motif · 264963–264973 · motif
· motif · 269537–269550 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:158 aa
ACP1 屬於 Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family。現有來源僅提供家族歸屬,未提供可據以描述其結構域、序列區段或其他蛋白質結構特徵的資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 ACP1 的細胞內定位記為細胞質,未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- OPTNQ96CV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ACP1 與 EPHA2、EPHB1 均有互作記錄;其中 EPHA2 另被記載為 ACP1 的去磷酸化對象。ACP1 也可與 SPTAN1 的 SH3 domain 互作,但此互作未見於 isoform 2 或 isoform 3。來源未說明這些關係是否涉及同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ACP1 可作用於酪胺酸磷酸化蛋白、低分子量芳基磷酸酯,以及天然和合成的醯基磷酸酯;isoform 1 與 isoform 2 在底物專一性上有所不同,但來源未說明差異方向或各自偏好的底物。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts on tyrosine phosphorylated proteins, low-MW aryl phosphates and natural and synthetic acyl phosphates with differences in substrate specificity between isoform 1 and isoform 2 PMID 10336608 ↗ · PMID 9705307 ↗ |
| 功能 | 此筆資料指出 ACP1 不具磷酸酶活性;來源未提供適用的條件、異構型或其他可進一步界定此說法的資訊。 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + H2O = L-tyrosyl-[protein] + phosphate | 推論支持 | |
| 分子活性 | a phosphate monoester + H2O = an alcohol + phosphate | 推論支持 | |
| 交互作用 | ACP1 與 EPHA2 及 EPHB1 有互作記錄;資料另指出 ACP1 可使 EPHA2 去磷酸化,但未說明這些互作的其他功能後果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with EPHA2; dephosphorylates EPHA2. Interacts with EPHB1 PMID 12167657 ↗ · PMID 9499402 ↗ |
| 交互作用 | ACP1 可與 SPTAN1 的 SH3 domain 互作;此互作未見於 isoform 2 或 isoform 3,來源未提供其他異構型差異或互作後果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with the SH3 domain of SPTAN1. There is no interaction observed for isoforms 2 or 3 PMID 11971983 ↗ |
| 細胞定位 | 此筆資料將 ACP1 的細胞內定位記為細胞質,未提供定位變化的條件或異構型差異。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCCTCTGCGCGCGGGAAGATGGCGGAACAGGCTACCAAGT40CCGTGCTGTTTGTGTGTCTGGGTAACATTTGTCGATCACC80CATTGCAGAAGCAGTTTTCAGGAAACTTGTAACCGATCAA120AACATCTCAGAGAATTGGAGGGTAGACAGCGCGGCAACTT160CCGGGTATGAGATAGGGAACCCCCCTGACTACCGAGGGCA200GAGCTGCATGAAGAGGCACGGCATTCCCATGAGCCACGTT240GCCCGGCAGATTACCAAAGAAGATTTTGCCACATTTGATT280ATATACTATGTATGGATGAAAGCAATCTGAGAGATTTGAA320TAGAAAAAGTAATCAAGTTAAAACCTGCAAAGCTAAAATT360GAACTACTTGGGAGCTATGATCCACAAAAACAACTTATTA400TTGAAGATCCCTATTATGGGAATGACTCTGACTTTGAGAC440GGTGTACCAGCAGTGTGTCAGGTGCTGCAGAGCGTTCTTG480GAGAAGGCCCACTGAGGCAGGTTCGTGCCCTGCTGCGGCC520AGCCTGACTAGACCCCACCCTGAGGTCCTGCATTTCTCAG560TCGGTGTGTAATCACGTTCCAGGGCCCAAAGCCCAGCTCT600TTGTTCAGTTGACTTACTGTTTCTTACCTTAAAAAGTAAT640TGTAGATGGAAATCAGTTGTGTTTGGCAGGAGAATCAATA680AAAATCTTTGATTCAGACAGCTTATGGGGTATTTTAAGCA720TTCTTAGACTAGTTGAACATCTCACTTTGCCCCAGTTACA760AAAATAGTAGAACAAGCAACATAAAACAATGAAGGAAAAC800CTCACTTGAAGGCCCAGGTCAACATCTAAGCCTGTTGAGA840CTTAGATAATCGAGTCTACCTCTTCAGTAGGTTTGTGTGG880ATGGCCTGGAGGGCAGGTGCCCTCTGCTCCCCAGTGCTAC920CTCTCTCTTCCCTAGGGCCTTTTGTGGATTGACAGTAGTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。