演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ACP1HAAP

acid phosphatase 1

ACP1(acid phosphatase 1)屬低分子量磷酸酪胺酸蛋白磷酸酶家族;來源記載其可作用於多類磷酸化底物,但另有資料指出其不具磷酸酶活性。

Homo sapiens2p25.3UniProt P24666
OFFICIAL SYMBOL
ACP1
CHROMOSOME
2
UNIPROT
P24666
PDB / ALPHAFOLD
4Z99
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ACP1 是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,正式名稱為 acid phosphatase 1,屬於 Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family。現有資料將其描述為可作用於酪胺酸磷酸化蛋白、低分子量芳基磷酸酯,以及天然與合成的醯基磷酸酯;不同異構型的底物專一性有所差異。另有資料記載其不具磷酸酶活性,但未提供可釐清此敘述與其他功能註記之間差異的條件或背景。

Official symbol
ACP1
Gene name
acid phosphatase 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:122
UniProt
P24666
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HAAPLMW-PTPLMWPTP

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22p25.3
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegACP1pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:264,140–280,057
Gene span
15,918 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000272065 ★264,947–278,2836
ENST00000407983264,876–272,5573
ENST00000439645264,876–272,6303
ENST00000405233264,876–273,1554
ENST00000272067264,876–280,0576
ENST00000896686264,876–280,0575
ENST00000896687264,876–280,0574
ENST00000896688264,876–280,0575
ENST00000896689264,876–280,0573
ENST00000896690264,876–280,0576
ENST00000896691264,876–280,0575
ENST00000972067264,876–280,0574

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ACP1 的資料記載包含兩種不同描述:一方面,其可作用於酪胺酸磷酸化蛋白、低分子量芳基磷酸酯,以及天然與合成的醯基磷酸酯;另一方面,另有註記指出它不具磷酸酶活性。來源未提供足以判定這些描述如何相互適用的條件,因此不宜將兩者合併成單一、無保留的功能結論。

所列反應式描述磷酸單酯與水反應,產生醇與磷酸;另列出酪胺酸磷酸化蛋白在水解後形成酪胺酸蛋白與磷酸。資料並指出,isoform 1 與 isoform 2 的底物專一性不同,但沒有進一步說明各自偏好的底物或差異方向。

在蛋白質關係方面,ACP1 與 EPHA2 及 EPHB1 有互作記錄;其中對 EPHA2 的資料另指出 ACP1 可使其去磷酸化。這提供了 ACP1 與受體蛋白磷酸化狀態相關的具體例子,但來源沒有說明其影響的生物學結果。整體而言,現有資訊支持其與多類含磷酸基底物及特定蛋白質的關聯,惟對作用條件與功能後果的描述有限。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 264947 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ACP1 ENST00000272065 GRCh38 chr2:263947-265047 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGGTGCTGCCGGACAGGTGGGTCCCCGGGTACTCACTGCTGCCCGCCCGGCCGCGGCGCCCCGTCCCGA
GGCTGCCCAGGAAGAGGAAGGCGCGCTGCCCCGCCCCGCGGACAAGGAGGCCCCAGCGAGGGCGTACCTG
CGGCAGGTGACGAAGGAGGCGGCGCAAAACACCCGCCGTGTACGTTTCGCGGGACAAAAACCACGCGCCC
GCCGGGCCGCGCTCAGGCCTTCGCCCTCAGGGACTTCGGAACCGCCCCGTCCTCAAGATCGAAAAGCCCA
GAGCCCCGCGGCGGCTCCAAGCACGGTGTTGGGGGTGGGGGTCTCAGGGAGCGCCCAGGCCCAAGGCCGC
CCTGGTCCGGCGTGGACCCCGCGGGGCTCAAGGCAGGTTCCCCGCGTGACCCGCCCAGCCCCTCTATGCG
AACTCGAACGACAGGCACCACAGCCCGCCACGTGCGCGAGACTCGCGCTGTGCCCCAACCCAGGTGGGCG
GCCCGCGGAGCCGCGAGGCCTGAGCCCGCCCTGCAGGTGACCCGCGGCCCTTCCTCCTCCAGGTACCCCT
CTCCTGCGGCCCCGTCCCCTATAGGTAACCTTTACCTCCCGCGGCTCCTTCCCCTCCAAGCGACCCGCAG
CCCCGCCCCCTCCAGGTGACTCCCCCCCGCCAACCCCCGCCACCACACACACACACCCCCTCGCCTTCCG
CGGCCCTACTCCCTCCAGGTGACCCCACCCCCGCAGCTCCTCCTCCTCCGGACAACCTGCAGCCCCGCCC
CTGCAGGTGAACGGCGGCCCAGTCCCTGCAGGTGACCCGCGGACCCTCCCCGCCCGTCCTACTACCGTCA
TAGGACCGCCTCCGCAGGCGCACTGGAGCCGATTGCGCAGGCGTGGCTCTCACACGCGCTGCCCTGTTGG
CGTTGGTGCGGGACTGCGCAGGCGCGCGGGGCAAGAGGGTGGCAGTGCGCCTGCGCCGCGTCGGCGTGCG
GAACGCCGCGGTGTCTCGGCGCCTCTGCGCGCGGGAAGATGGCGGAACAGGCTACCAAGTCCGTGCTGTT
TGTGTGTCTGGGTAAGAGGGCGCCGACTTACTCATGTTCTGACGTCCTCTG
ACP1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ACP1_1 ↗2:264,947正股264,898–264,957

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_94RH · enhancer · 260747–261084 · regulatory

ENSR2_B3F5 · enhancer · 263129–264021 · regulatory

ENSR2_B3F8 · promoter · 264022–264669 · regulatory

ENSR2_53NCX · CTCF_binding_site · 264576–264597 · regulatory

ENSR2_87N9 · promoter · 264800–264957 · regulatory

ENSR2_B3FD · enhancer · 264958–265903 · regulatory

· motif · 259981–259992 · motif

· motif · 260129–260138 · motif

· motif · 260129–260138 · motif

· motif · 260406–260420 · motif

· motif · 260406–260420 · motif

· motif · 260788–260803 · motif

· motif · 260789–260803 · motif

· motif · 260882–260895 · motif

· motif · 260882–260895 · motif

· motif · 263845–263862 · motif

· motif · 263847–263862 · motif

· motif · 263854–263862 · motif

· motif · 263871–263886 · motif

· motif · 264372–264389 · motif

· motif · 264381–264396 · motif

· motif · 264425–264434 · motif

· motif · 264578–264591 · motif

· motif · 264578–264594 · motif

· motif · 264628–264641 · motif

· motif · 264670–264683 · motif

· motif · 264710–264723 · motif

· motif · 264791–264804 · motif

· motif · 264797–264808 · motif

· motif · 264797–264808 · motif

· motif · 264820–264831 · motif

· motif · 264820–264831 · motif

· motif · 264855–264871 · motif

· motif · 264871–264882 · motif

· motif · 264871–264882 · motif

· motif · 264902–264913 · motif

· motif · 264902–264913 · motif

· motif · 264911–264924 · motif

· motif · 264963–264973 · motif

· motif · 269537–269550 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:158 aa

ACP1 屬於 Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family。現有來源僅提供家族歸屬,未提供可據以描述其結構域、序列區段或其他蛋白質結構特徵的資訊。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4Z99…

PDB · 4Z99

X-ray · 2.30 A · A=1-158

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

來源將 ACP1 的細胞內定位記為細胞質,未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HAAPACP1OPTN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ACP1 與 EPHA2、EPHB1 均有互作記錄;其中 EPHA2 另被記載為 ACP1 的去磷酸化對象。ACP1 也可與 SPTAN1 的 SH3 domain 互作,但此互作未見於 isoform 2 或 isoform 3。來源未說明這些關係是否涉及同一複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ACP1 可作用於酪胺酸磷酸化蛋白、低分子量芳基磷酸酯,以及天然和合成的醯基磷酸酯;isoform 1 與 isoform 2 在底物專一性上有所不同,但來源未說明差異方向或各自偏好的底物。含實驗來源
證據與來源

Acts on tyrosine phosphorylated proteins, low-MW aryl phosphates and natural and synthetic acyl phosphates with differences in substrate specificity between isoform 1 and isoform 2

PMID 10336608 ↗ · PMID 9705307 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能此筆資料指出 ACP1 不具磷酸酶活性;來源未提供適用的條件、異構型或其他可進一步界定此說法的資訊。含實驗來源
證據與來源

Does not possess phosphatase activity

PMID 10336608 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + H2O = L-tyrosyl-[protein] + phosphate推論支持
證據與來源

O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + H2O = L-tyrosyl-[protein] + phosphate

PMID 9705307 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性a phosphate monoester + H2O = an alcohol + phosphate推論支持
證據與來源

a phosphate monoester + H2O = an alcohol + phosphate

PMID 10336608 ↗ · PMID 9705307 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ACP1 與 EPHA2 及 EPHB1 有互作記錄;資料另指出 ACP1 可使 EPHA2 去磷酸化,但未說明這些互作的其他功能後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with EPHA2; dephosphorylates EPHA2. Interacts with EPHB1

PMID 12167657 ↗ · PMID 9499402 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ACP1 可與 SPTAN1 的 SH3 domain 互作;此互作未見於 isoform 2 或 isoform 3,來源未提供其他異構型差異或互作後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with the SH3 domain of SPTAN1. There is no interaction observed for isoforms 2 or 3

PMID 11971983 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位此筆資料將 ACP1 的細胞內定位記為細胞質,未提供定位變化的條件或異構型差異。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000272065 · 1,474 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCTCTGCGCGCGGGAAGATGGCGGAACAGGCTACCAAGT40
41CCGTGCTGTTTGTGTGTCTGGGTAACATTTGTCGATCACC80
81CATTGCAGAAGCAGTTTTCAGGAAACTTGTAACCGATCAA120
121AACATCTCAGAGAATTGGAGGGTAGACAGCGCGGCAACTT160
161CCGGGTATGAGATAGGGAACCCCCCTGACTACCGAGGGCA200
201GAGCTGCATGAAGAGGCACGGCATTCCCATGAGCCACGTT240
241GCCCGGCAGATTACCAAAGAAGATTTTGCCACATTTGATT280
281ATATACTATGTATGGATGAAAGCAATCTGAGAGATTTGAA320
321TAGAAAAAGTAATCAAGTTAAAACCTGCAAAGCTAAAATT360
361GAACTACTTGGGAGCTATGATCCACAAAAACAACTTATTA400
401TTGAAGATCCCTATTATGGGAATGACTCTGACTTTGAGAC440
441GGTGTACCAGCAGTGTGTCAGGTGCTGCAGAGCGTTCTTG480
481GAGAAGGCCCACTGAGGCAGGTTCGTGCCCTGCTGCGGCC520
521AGCCTGACTAGACCCCACCCTGAGGTCCTGCATTTCTCAG560
561TCGGTGTGTAATCACGTTCCAGGGCCCAAAGCCCAGCTCT600
601TTGTTCAGTTGACTTACTGTTTCTTACCTTAAAAAGTAAT640
641TGTAGATGGAAATCAGTTGTGTTTGGCAGGAGAATCAATA680
681AAAATCTTTGATTCAGACAGCTTATGGGGTATTTTAAGCA720
721TTCTTAGACTAGTTGAACATCTCACTTTGCCCCAGTTACA760
761AAAATAGTAGAACAAGCAACATAAAACAATGAAGGAAAAC800
801CTCACTTGAAGGCCCAGGTCAACATCTAAGCCTGTTGAGA840
841CTTAGATAATCGAGTCTACCTCTTCAGTAGGTTTGTGTGG880
881ATGGCCTGGAGGGCAGGTGCCCTCTGCTCCCCAGTGCTAC920
921CTCTCTCTTCCCTAGGGCCTTTTGTGGATTGACAGTAGTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。