演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ACOX3

acyl-CoA oxidase 3, pristanoyl

ACOX3(acyl-CoA oxidase 3, pristanoyl)是過氧化體脂肪酸 β-氧化相關酵素,主要作用於具甲基分支的脂肪酸 CoA 酯,催化氧化途徑的起始步驟。

Homo sapiens4p16.1UniProt O15254
OFFICIAL SYMBOL
ACOX3
CHROMOSOME
4
UNIPROT
O15254
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ACOX3 是蛋白質編碼基因,產物屬於 acyl-CoA oxidase 家族,主要與過氧化體中的脂肪酸代謝相關。其名稱中的 pristanoyl 指向其可處理的底物類型;來源資料指出,ACOX3 可氧化具 2-甲基分支的脂肪酸 CoA 酯,也能作用於多甲基分支脂肪醯基 CoA 酯。它亦可處理直鏈單羧酸及二羧酸脂肪醯基 CoA,但效率較低。其蛋白質具有位於末端的 microbody targeting signal,位置在第 698–700 個胺基酸;此為序列特徵註解。ACOX3 的功能資料涵蓋不同鏈長及分支型態的脂肪醯基 CoA,並包含具體的 pristanoyl-CoA 反應。

Official symbol
ACOX3
Gene name
acyl-CoA oxidase 3, pristanoyl
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:121
UniProt
O15254
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44p16.1
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25ACOX3pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr4:8,364,703–8,440,750
Gene span
76,048 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000356406 ★8,366,282–8,440,72318
ENST000008954058,365,351–8,440,75017
ENST000008954068,365,351–8,436,05318
ENST000008954078,365,351–8,436,05317
ENST000008954088,365,351–8,428,49316
ENST000008954098,365,351–8,428,49317
ENST000008954108,365,351–8,428,49318
ENST000008954118,365,351–8,428,49317
ENST000008954128,365,351–8,428,49316
ENST000008954138,365,351–8,428,49317
ENST000008954148,365,351–8,428,49317
ENST000008954158,365,351–8,428,49318

顯示 12/49 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ACOX3 參與過氧化體中的支鏈脂肪酸 β-氧化,作用對象包括具 2-甲基分支及多甲基分支的脂肪酸 CoA 酯。它催化此氧化途徑的初始且限速的去氫步驟:從脂肪醯基 CoA 移除兩個氫,並在底物的 α、β 碳之間形成 trans 雙鍵,同時產生過氧化氫作為副產物。這項反應將飽和脂肪醯基 CoA 轉為具有 2E 雙鍵的 enoyl-CoA。

已列出的反應底物包括 (2S)-pristanoyl-CoA,產物為 (2E)-pristenoyl-CoA;此外,十碳、十六碳及二十四碳脂肪醯基 CoA 也分別可形成相應的 2E-enoyl-CoA。資料亦列出二羧酸底物 hexadecanedioyl-CoA,可轉為 hexadecenedioyl-CoA。這些例子呈現其可作用底物的鏈長與羧基型態,但來源對部分反應的證據註記為相似性推定,因此不宜將所有底物例子視為同等程度的直接驗證。

ACOX3 對直鏈單羧酸及二羧酸脂肪醯基 CoA 的氧化效率較低;此項底物範圍屬相似性註記。來源也描述其處理多甲基分支脂肪醯基 CoA 酯的能力,並指出該作用與 ACOX3 存在功能冗餘;此處依原文保留該關係,不進一步推論兩者的調控或生理分工。

整體而言,ACOX3 透過催化脂肪醯基 CoA 的起始去氫反應,參與過氧化體脂肪酸 β-氧化與脂質代謝。其反應會形成 enoyl-CoA 並伴隨過氧化氫生成;來源支持這些底物轉換與代謝角色,但未提供其下游反應或過氧化氫後續處理的細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 8440723 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ACOX3 ENST00000356406 GRCh38 chr4:8440623-8441723 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACACCTACAGCTTTACCTGCTAAACTCCTAGGTATTACGCAATATCCAGCTAGTCCTTCACTGTCTCTTT
GAAGCCTTCCAGACACCACCCCAATCAATTATCCCATCTTCTGTACTAAGGACACACATTTCTATGCGCC
CACTCAAAAAACTATGAAACACCTAACAACCTCCCTAGGACATCGCAGAGGAACTAGTACCCTTAGGACT
TTTTCATTGACCCGAGGTTCTATGAATGCTTTTTTATCTAATCATATCCGTCCACTATCAAAACACTCTT
ACCTTGCACGACTATTTCCCTCCTGGGAGTTGTAAGGGGGCAATGTGGGCTAGTTTTCGGGATGACGGTT
CTGAGAACCACGTCGAGCTCACGCTGCGCCTCTGGCTGCGATCCCGCCCCGGAGCTGGTGAGGAAGGCCA
GCAACTCCGAATTGCCACGGGCGAGACTTTGGGAGAAATCCTCCCAAAGCGAATCCAGATCTGCGGCGGG
GAAGTCGCCCTCCCTTCCTTCAGCATGGCCGGGGTGCCCGGAGTCCCTCAGGGGCACTGAGGCGGCTTCC
CTCTGTGCCTCCTCTTGCTGGCACTGGCCCTGGGCCTCCTCAAGTTCGCAACATGCCGTGCCCTGCTCGG
GTCCTGATAGCGACCTGGGACCCGGGCCCCCTCCGGGGGAACCCTGGCCGGGTCCCGGACCCCGCTCCTT
CTGCTCCGAGCCTGCGCTAGTCCCGGGGCCGCGGGCCTCCGCGCAGGGCAGGGCGGCGCTCCAGCGGGCC
TCCAGGCGGGCGCCGCAAAGCCGTTTGTTTGCCACCTGCGGCCTCTCCAGCCACACTTCGACCGCAGCCC
AGAAGCCCTGTGGGAGAAGCGCGCCTGGGTAGCTGATCCCGGTACGGCCCACCTCAGCCATGGCAGCCAG
CAGGTGTACAGCCCTGGCAGCGGCGCGCCGAGATGACGCAGCCCGGTGGCGCGGCGCGTTGACGTCATGG
AGGCGGGGTGCTGGGACCGGAAATGAGAATGGCGCCGCTGGAGATCCTTTCCTGCTTTTGGTTTCCCTGG
CAGGGGTTGAACTGTGGAGTGTGTGGGTGAGGAATTTGACCTGTGTTTTAT
ACOX3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ACOX3_1 ↗4:8,428,448負股8,428,438–8,428,497
ACOX3_2 ↗4:8,440,723負股8,440,713–8,440,772

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_B3N7G · enhancer · 8435571–8436220 · regulatory

ENSR4_B3N7P · enhancer · 8437223–8437946 · regulatory

ENSR4_B3N85 · enhancer · 8440123–8440712 · regulatory

ENSR4_53ZL8L · CTCF_binding_site · 8440320–8440341 · regulatory

ENSR4_7HDSD · promoter · 8440713–8440787 · regulatory

ENSR4_53ZLBM · CTCF_binding_site · 8440759–8440780 · regulatory

ENSR4_53ZLDF · CTCF_binding_site · 8441142–8441163 · regulatory

· motif · 8440322–8440338 · motif

· motif · 8440554–8440564 · motif

· motif · 8440595–8440605 · motif

· motif · 8440631–8440646 · motif

· motif · 8440719–8440728 · motif

· motif · 8440744–8440757 · motif

· motif · 8440744–8440757 · motif

· motif · 8440761–8440777 · motif

· motif · 8440806–8440815 · motif

· motif · 8440880–8440895 · motif

· motif · 8441144–8441160 · motif

· motif · 8441681–8441690 · motif

· motif · 8441681–8441690 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:700 aa

1 aa700 aa基序
依 O15254 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ACOX3 屬於 acyl-CoA oxidase 家族,蛋白質長度為 700 個胺基酸。序列註解指出,其第 698–700 個胺基酸構成 microbody targeting signal。

基序Microbody targeting signal698–700 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O15254…

AlphaFold · O15254

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Peroxisome

ACOX3 的定位資料指向過氧化體;來源未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。

未繪示構造:Peroxisome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ACOX3ACOX3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

10 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 10 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ACOX3 參與過氧化體支鏈脂肪酸 β-氧化,催化初始且限速的去氫反應,移除兩個氫並在脂肪醯基 CoA 的 α、β 碳間形成 trans 雙鍵,同時產生過氧化氫。它可代謝 (2S)-pristanoyl-CoA 等多甲基分支底物,並可較低效率氧化直鏈單羧酸及二羧酸脂肪醯基 CoA;後者依相似性註記。含實驗來源
證據與來源

Involved in peroxisomal beta-oxidation of branched-chain fatty acids (BCFAs). Catalyzes the initial and rate-limiting dehydrogenation step that removes two hydrogen molecules and introduces a trans double bond between the alpha and beta carbons of the acyl CoA molecules while generating hydrogen peroxide as a by-product. Metabolizes multi-methyl-branched fatty acyl-CoA esters such as (2S)-pristanoyl-CoA, displaying redundancy with ACOX3. Can oxidize straight-chain mono- and dicarboxylyl fatty acyl-CoAs with lower efficiency (By similarity)

PMID 29287774 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能ACOX3 可氧化具 2-甲基分支脂肪酸的 CoA 酯。推論支持
證據與來源

Oxidizes the CoA-esters of 2-methyl-branched fatty acids

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性a 2,3-saturated acyl-CoA + O2 = a (2E)-enoyl-CoA + H2O2含實驗來源
證據與來源

a 2,3-saturated acyl-CoA + O2 = a (2E)-enoyl-CoA + H2O2

PMID 29287774 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性(2S)-pristanoyl-CoA + O2 = (2E)-pristenoyl-CoA + H2O2含實驗來源
證據與來源

(2S)-pristanoyl-CoA + O2 = (2E)-pristenoyl-CoA + H2O2

PMID 29287774 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性decanoyl-CoA + O2 = (2E)-decenoyl-CoA + H2O2含實驗來源
證據與來源

decanoyl-CoA + O2 = (2E)-decenoyl-CoA + H2O2

PMID 29287774 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hexadecanoyl-CoA + O2 = (2E)-hexadecenoyl-CoA + H2O2推論支持
證據與來源

hexadecanoyl-CoA + O2 = (2E)-hexadecenoyl-CoA + H2O2

PMID 29287774 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性tetracosanoyl-CoA + O2 = (2E)-tetracosenoyl-CoA + H2O2推論支持
證據與來源

tetracosanoyl-CoA + O2 = (2E)-tetracosenoyl-CoA + H2O2

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hexadecanedioyl-CoA + O2 = (2E)-hexadecenedioyl-CoA + H2O2推論支持
證據與來源

hexadecanedioyl-CoA + O2 = (2E)-hexadecenedioyl-CoA + H2O2

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ACOX3 與脂質代謝及過氧化體脂肪酸 β-氧化相關。資料庫紀錄
證據與來源

Lipid metabolism; peroxisomal fatty acid beta-oxidation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Peroxisome推論支持
證據與來源

Peroxisome

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 10 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000356406 · 2,872 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAATGAGAATGGCGCCGCTGGAGATCCTTTCCTGCTTTTG40
41GTTTCCCTGGCAGGGGTTGAACTGTGGAGTGTGTGGGCTC80
81TTATCACGCGATGGCATCCACTGTGGAAGGAGGCGACACA120
121GCTCTGCTCCCAGAATTCCCCAGGGGGCCCCTCGATGCCT160
161ACCGAGCAAGAGCGTCCTTCAGCTGGAAGGAGCTGGCGCT200
201GTTCACGGAAGGGGAGGGCATGCTCCGCTTTAAGAAAACC240
241ATCTTCTCAGCTCTTGAGAATGACCCTCTTTTCGCTCGTT280
281CCCCTGGAGCCGATCTGTCCTTGGAGAAGTATCGCGAGCT320
321GAACTTCCTTCGATGCAAGCGGATCTTCGAGTATGACTTC360
361CTCAGTGTCGAAGACATGTTCAAGAGCCCTCTGAAGGTCC400
401CCGCCTTGATTCAGTGCCTGGGCATGTATGACTCTTCTCT440
441GGCTGCCAAGTACCTCCTCCATAGCTTGGTTTTTGGATCA480
481GCAGTTTACAGTTCTGGTTCTGAAAGACATCTCACATATA520
521TTCAAAAGATCTTCAGGATGGAGATTTTTGGATGTTTTGC560
561TCTGACCGAATTAAGCCACGGCAGTAATACCAAGGCCATT600
601CGCACAACTGCCCACTACGATCCTGCCACTGAGGAATTCA640
641TCATACATTCCCCTGATTTCGAAGCTGCCAAGTTTTGGGT680
681TGGCAACATGGGCAAGACAGCCACTCACGCGGTGGTGTTT720
721GCTAAGCTGTGTGTGCCAGGGGACCAGTGCCATGGGCTGC760
761ATCCCTTTATCGTGCAGATCCGGGACCCGAAGACCCTTCT800
801TCCCATGCCTGGAGTGATGGTTGGCGACATAGGAAAAAAA840
841CTCGGGCAGAACGGTCTGGATAATGGTTTCGCCATGTTCC880
881ACAAGGTCAGAGTTCCTCGCCAGAGCCTTCTGAACCGGAT920
921GGGAGACGTCACCCCCGAGGGCACCTATGTCAGCCCCTTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。