基因總覽
ACOX2 是一個蛋白質編碼基因，產物 acyl-CoA oxidase 2 屬於 acyl-CoA oxidase 家族。這種酵素在過氧化體中作用，參與支鏈脂肪酸及膽汁酸合成中間物的代謝。其蛋白質長度為 681 個胺基酸，序列末端帶有微體定位訊號。來源所述的底物包含不同支鏈型態的脂肪醯基輔酶 A，以及膽汁酸合成途徑中的 C27 中間物；對直鏈脂肪醯基輔酶 A 也有氧化能力，但效率較低。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000302819 ★ | 58,505,136–58,537,190 | 15 |
| ENST00000459701 | 58,504,544–58,537,387 | 15 |
| ENST00000900712 | 58,504,544–58,537,387 | 16 |
| ENST00000900713 | 58,504,544–58,537,387 | 16 |
| ENST00000900714 | 58,504,544–58,537,387 | 15 |
| ENST00000900715 | 58,504,544–58,537,387 | 16 |
| ENST00000900716 | 58,504,544–58,537,387 | 14 |
| ENST00000900717 | 58,504,544–58,537,387 | 15 |
| ENST00000900718 | 58,504,544–58,537,387 | 15 |
| ENST00000900719 | 58,504,544–58,537,387 | 13 |
| ENST00000900720 | 58,504,544–58,537,387 | 16 |
| ENST00000900721 | 58,504,544–58,537,387 | 15 |
顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ACOX2 參與過氧化體中的脂肪酸 β-氧化，主要處理支鏈脂肪酸和膽汁酸合成中間物。它催化氧化途徑的起始且限速脫氫步驟，從脂肪醯基輔酶 A 移除兩個氫原子，並在 α、β 碳之間形成 trans 雙鍵；反應同時產生過氧化氫。其底物氧化具有立體專一性，依相似性推定，僅能使帶有 (2S)-甲基的異構物脫氫。
在棕色脂肪組織的過氧化體中，ACOX2 參與具有 iso 構型的單甲基支鏈脂肪酸（mmBCFAs）β-氧化。這項分解作用屬於底物合成與氧化循環的一環；循環中的 mmBCFAs 由 FASN 依賴的新生合成提供。依相似性推定，mmBCFA 分解與 AMPK 活化及粒線體 ATP 生成相連，並作為寒冷環境下維持體溫的產熱適應機制。
ACOX2 也可代謝含多個甲基支鏈的脂肪醯基輔酶 A，例如 (2S)-pristanoyl-CoA；這項功能與 ACOX3 有部分重疊。實例反應包括將 isopentadecanoyl-CoA、isoheptadecanoyl-CoA 和 (2S)-pristanoyl-CoA 分別轉為相應的 trans 烯醯基輔酶 A，並產生過氧化氫。
在肝臟中，ACOX2 介導帶有 (25S)-甲基的 C27 膽汁醯基輔酶 A 中間物側鏈 β-氧化，形成 24,25-trans 不飽和衍生物，參與過氧化體膽汁酸合成途徑。來源列出的底物包括 (25S)-3α,7α,12α-trihydroxy-5β-cholestan-26-oyl-CoA。ACOX2 亦能氧化直鏈底物 decanoyl-CoA 與 hexadecanoyl-CoA，但此類底物的氧化效率較低。
Promoter 與基因調控
>ACOX2 ENST00000302819 GRCh38 chr3:58537090-58538190 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGAAGGACCTACTAGGTGATAAGTTGCAAAGCTTGGGCCACAGGTCCTGCCTCTTCCTACAGACACAAGC TAGACACTACCTTGGGGATATGATGGGGTGCTGTGAGGCTCCTTACTGAGCAAATACCTTGCATTACAGG GGAGGCCAAGGCCCAGAAAGGAGTACACCTGCTCAGAGTCAACATAGCTCAGAAGTCCTGCCAGAACAGG AGCCTTGATCTCCTACTGGCCCCTTGATTTCTTTCCCAGTCTTACACAAATGTGTTACGTAATCTACTTA TTGTGCAAACCCAAACAAAGTGACATCCCTCCCTGAGCCTGTTTCCTTACCTGCAAAATGGGGAGCCGCA TCTGACTTTCCAAGGTGGTTATGCAGGGAGGGAACCTCTAAGCCTCTCATTCCTCTCACTAAGACCCAGC TCTCATCTGGATCCCACACACTACAGATGGATGCTTCACAAATATTTTTCCAGGGAATGTCAGGGGATGC TAAGCATAAGACAAGCCATATTTTAGAGCAGAAACATGGGGAGAGAGGAAAAACGTACACCTTACAGAGC AATCCTTTCACATGAGGACCATCTCAGGGGAGCCTATTAAGCTCGTGTGATATTAACAGCTTGAGTGCCT GAAGGGCACACAGTGAAAGATCAGGGAAGACCAGGATATCACTTTGGAAACACTGCTGGGGTACACAGCT TTTTGGTACAAGTAGTGTCAAAGGAATCCCTGGCTTTGAGATGTAAGGGCTCCAACCTCCCAGAAGTCCT CCCAGGGCAGCCCCAGCGACAGGCACAAAGGTCACACCCATGCAGGAAGAGAGGGAGGAAGGAGAGGAGC TCCATAAGCCCAGACAAGGGCTTGAGAGCAGACAAGGGCTTGAGAGCAGACAAGGGCTTGAGAGCAGACA AGGGCTTGAGAGCTGGCCAAGCAGTTTCTCTCAGCTTCTGTGTTCCAGCCCCTATGTGGGAGGAGAGAAG GGCAGGACCACAAGCCTGCCAGAGGCTGCGGCCTACAGCCGGGGAGAGGCCAGCCCGGCCTACAGTGCGG ACACAGGACAGAGGGGAGCCAGGTGAGCCAGGTTTTTGGGCAGGGAGGGAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ACOX2_1 ↗ | 3:58,537,190 | 負股 | 58,537,180–58,537,239 |
| ACOX2_2 ↗ | 3:58,537,366 | 負股 | 58,537,356–58,537,415 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_83PGJQ · enhancer · 58532062–58532246 · regulatory
ENSR3_BFLMB · enhancer · 58532645–58533373 · regulatory
ENSR3_5HQPHR · CTCF_binding_site · 58532923–58532944 · regulatory
ENSR3_5HQPL9 · CTCF_binding_site · 58533454–58533475 · regulatory
ENSR3_BFLMR · enhancer · 58535837–58536670 · regulatory
ENSR3_9T8BR · enhancer · 58536900–58537179 · regulatory
ENSR3_9T8BT · promoter · 58537180–58537483 · regulatory
ENSR3_9T8C3 · enhancer · 58537814–58538070 · regulatory
· motif · 58532925–58532941 · motif
· motif · 58533456–58533472 · motif
· motif · 58535994–58536009 · motif
· motif · 58536168–58536181 · motif
· motif · 58536192–58536207 · motif
· motif · 58536450–58536463 · motif
· motif · 58537918–58537927 · motif
· motif · 58537918–58537927 · motif
· motif · 58538034–58538049 · motif
· motif · 58540649–58540660 · motif
· motif · 58540653–58540667 · motif
· motif · 58540653–58540667 · motif
· motif · 58540999–58541010 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：681 aa
acyl-CoA oxidase 2 長 681 個胺基酸，屬於 acyl-CoA oxidase 家族。蛋白質序列第 679 至 681 位註解有微體定位訊號，與其過氧化體定位相符。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ACOX2 位於過氧化體。 來源未提供其在不同條件下的定位變化或異構型間的定位差異。
未繪示構造：Peroxisome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- DYNLT1P63172 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STRN3Q13033 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ACOX2 被註解為同源二聚體。這項資料描述其亞基組成，未提供其他蛋白質結合夥伴或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
ACOX2 變異可造成先天性膽汁酸合成缺陷 6（CBAS6），此病符合體染色體隱性遺傳。臨床特徵包括肝酵素升高、低脂血症、低膽固醇、維生素 D 缺乏，以及血漿和尿液中的 C27 膽汁酸中間物升高；血清植烷酸與姥鮫烷酸則正常。患者可能有肝纖維化、輕度共濟失調、發育遲緩與認知障礙。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 12 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ACOX2 參與過氧化體中支鏈脂肪酸與膽汁酸中間物的 β-氧化，催化移除兩個氫並形成 trans 雙鍵的起始限速步驟，同時產生過氧化氫；其底物氧化具立體專一性，依相似性推定僅作用於帶有 (2S)-甲基的異構物。在棕色脂肪組織，mmBCFA 分解與 AMPK 活化及粒線體 ATP 生成相連，可能協助寒冷時維持體溫；亦可代謝 (2S)-pristanoyl-CoA，並參與肝臟 C27 膽汁酸中間物側鏈氧化。直鏈脂肪醯基輔酶 A 可被氧化，但效率低。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in peroxisomal beta-oxidation of branched-chain fatty acids (BCFAs) and bile acids intermediates. Catalyzes the initial and rate-limiting dehydrogenation step that removes two hydrogen molecules and introduces a trans double bond between the alpha and beta carbons of the acyl CoA molecules while generating hydrogen peroxide as a by-product. Oxidizes its substrates in a stereospecific way and can only desaturate isomers carrying (2S)-methyl groups (By similarity). In brown adipose tissue peroxisomes, mediates beta-oxidation of monomethyl branched-chain fatty acids with iso configuration (mmBCFAs) as part of a substrate synthesis and oxidation cycle fueled by FASN-dependent de novo mmBCFA synthesis. The mmBCFA catabolism is coupled to AMPK activation and mitochondrial ATP production as a thermogenic adaptation mechanism to maintain the body temperature in cold environment (By similarity). Metabolizes multi-methyl-branched fatty acyl-CoA esters such as (2S)-pristanoyl-CoA, displaying redundancy with ACOX3. In the liver, mediates side-chain beta-oxidation of C27 bile acyl-CoA intermediates carrying a (25S)-methyl group to yield 24,25-trans unsaturated derivatives as part of peroxisomal bile acid synthesis pathway. Can oxidize straight-chain fatty acyl CoAs such as C10-CoA and C16-CoA with low efficiency PMID 27884763 ↗ · PMID 29287774 ↗ |
| 分子活性 | a 2,3-saturated acyl-CoA + O2 = a (2E)-enoyl-CoA + H2O2 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | isopentadecanoyl-CoA + O2 = (2E)-13-methyltetradecenoyl-CoA + H2O2 | 推論支持 | |
| 分子活性 | isoheptadecanoyl-coA + O2 = (2E)-15-methylhexadecenoyl-CoA + H2O2 | 推論支持 | |
| 分子活性 | (2S)-pristanoyl-CoA + O2 = (2E)-pristenoyl-CoA + H2O2 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | (25S)-3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholestan-26-oyl-CoA + O2 = (24E)-3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholest-24-en-26-oyl-CoA + H2O2 | 含實驗來源 | 證據與來源(25S)-3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholestan-26-oyl-CoA + O2 = (24E)-3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholest-24-en-26-oyl-CoA + H2O2 PMID 27884763 ↗ · PMID 29287774 ↗ |
| 分子活性 | decanoyl-CoA + O2 = (2E)-decenoyl-CoA + H2O2 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | hexadecanoyl-CoA + O2 = (2E)-hexadecenoyl-CoA + H2O2 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | ACOX2 與脂質代謝及過氧化體脂肪酸 β-氧化有關。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | Homodimer | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Peroxisome | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | ACOX2 變異可造成先天性膽汁酸合成缺陷 6（CBAS6），其遺傳模式符合體染色體隱性。疾病特徵包括肝酵素異常升高、低脂血症與低膽固醇、維生素 D 缺乏，以及血漿和尿液中 DHCA、THCA 等 C27 膽汁酸中間物升高；植烷酸與姥鮫烷酸血清濃度正常。臨床表現可包括肝纖維化、輕度共濟失調、發育遲緩及認知障礙；肝組織可見纖維隔、肝細胞腫脹等損傷與再生變化，且無明顯膽汁鬱積或脂肪變性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Congenital bile acid synthesis defect 6 CBAS6 An inborn error of bile acid synthesis characterized by abnormally increased liver enzymes, hypolipidemia and low cholesterol, vitamin D deficiency, elevated plasma and urinary levels of C27 intermediate bile acids 3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholestanoic acid (DHCA) and 3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholestanoic acid (THCA). Serum levels of phytanic and pristanic acids are normal. Clinical features include liver fibrosis, mild ataxia, delayed development, and cognitive impairment. Liver histology shows many thin fibrous septa, swollen hepatocytes, glycogenated nuclei, and focal acinar transformation, consistent with hepatocellular injury and regeneration, without signs of obvious cholestasis, cholate stasis, or steatosis. CBAS6 transmission pattern is consistent with autosomal recessive inheritance. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617308 PMID 27647924 ↗ · PMID 27884763 ↗ · PMID 29287774 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAGGCTGCGGCCTACAGCCGGGGAGAGGCCAGCCCGGCC40TACAGTGCGGACACAGGACAGAGGGGAGCCAGGTTCTTTG80CACTGACCAATGCTGAGAGCAGACCCTCGGAGCAGCCGGG120TTGGAAGTGTCTCTCCATAGTCACCAGACAGATCCAGGAT160AGGATGGGCAGCCCAGTGCACCGAGTGTCATTGGGGGATA200CCTGGAGCAGGCAAATGCACCCCGACATAGAGAGCGAGAG240GTATATGCAGTCCTTTGACGTGGAACGGCTCACCAACATC280CTTGATGGAGGTGCCCAGAACACTGCACTCCGCAGGAAAG320TTGAGAGCATCATCCACAGTTACCCGGAGTTTAGCTGTAA360GGACAATTATTTCATGACCCAGAATGAGCGTTATAAGGCT400GCCATGCGGAGGGCATTCCACATCCGGTTGATAGCTCGGC440GCCTGGGTTGGTTAGAAGATGGTCGTGAATTAGGCTACGC480TTACAGAGCCCTTTCTGGAGACGTGGCCTTAAATATACAC520AGAGTCTTCGTGAGAGCCCTCAGGAGCCTGGGCTCAGAGG560AGCAGATTGCCAAATGGGACCCACTCTGCAAAAACATCCA600GATCATCGCAACGTATGCACAGACAGAGTTGGGACATGGG640ACATATCTTCAGGGCCTGGAGACTGAAGCCACCTATGACG680CAGCCACCCAGGAGTTTGTGATACACAGCCCCACGCTGAC720TGCCACCAAATGGTGGCCTGGAGACTTGGGACGGTCAGCC760ACCCATGCCCTGGTCCAGGCCCAGCTGATCTGCTCAGGAG800CCAGGCGGGGCATGCACGCTTTTATTGTGCCAATCCGGAG840TCTTCAGGACCACACCCCACTGCCAGGAATCATCATTGGG880GACATCGGACCCAAGATGGACTTTGATCAAACAGACAATG920GCTTCCTGCAGCTGAACCATGTGCGGGTCCCCAGGGAGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。