基因總覽
ACLY 是蛋白質編碼基因，產物為 ATP citrate lyase。此酵素催化 citrate 裂解，產生 oxaloacetate 與 acetyl-CoA；其中 acetyl-CoA 是蛋白質、醣類與脂質代謝中多種生化反應共用的基質。其序列包含 ATP-grasp 結構域，並分別具有與 succinate/malate CoA ligase beta subunit family 和 succinate/malate CoA ligase alpha subunit family 相符的區段。這些註解概述了蛋白質的結構與家族特徵；具體催化反應及其代謝意義另於功能段說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000352035 ★ | 41,866,918–41,918,951 | 29 |
| ENST00000590151 | 41,866,916–41,919,084 | 29 |
| ENST00000353196 | 41,866,916–41,919,084 | 28 |
| ENST00000537919 | 41,866,916–41,919,084 | 21 |
| ENST00000393896 | 41,866,916–41,919,084 | 28 |
| ENST00000884501 | 41,866,916–41,930,551 | 28 |
| ENST00000884502 | 41,866,916–41,930,551 | 29 |
| ENST00000884503 | 41,866,916–41,919,669 | 29 |
| ENST00000884504 | 41,866,916–41,919,669 | 29 |
| ENST00000884505 | 41,866,916–41,919,669 | 28 |
| ENST00000884506 | 41,866,916–41,919,084 | 29 |
| ENST00000884507 | 41,866,916–41,919,084 | 29 |
顯示 12/59 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ATP citrate lyase 催化 citrate 裂解為 oxaloacetate 與 acetyl-CoA。這項反應將 citrate 轉化為兩種產物，其中 acetyl-CoA 可作為多種生化反應共用的基質，因此該酵素的作用與多類代謝反應相連。
來源列出的反應式為：oxaloacetate + acetyl-CoA + ADP + phosphate = citrate + ATP + CoA。這個反應式呈現反應物與產物的組成；功能註解則描述酵素催化 citrate 裂解，生成 oxaloacetate 和 acetyl-CoA。依據來源，不能將 acetyl-CoA 的用途限縮於單一代謝途徑。
在代謝層面，產生的 acetyl-CoA 可供蛋白質、醣類與脂質代謝中的多種生化反應使用。來源未進一步指定各類反應的細節，也未提供這些代謝用途之間的調控關係，因此可支持的功能描述以 citrate 裂解、產物生成及 acetyl-CoA 的共用基質角色為限。
Promoter 與基因調控
>ACLY ENST00000352035 GRCh38 chr17:41918851-41919951 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGGTTGGGGTGCAGGTAGGGAGGGAGGCTGCAGCATGTCAGAGTGGTAAATACATGTCCTGATTTCCAG GACTGATTTCACATATTCTGCCCCACAAGTTCACCAGCACCTGTCAGATTGGATGTCCCAGTTTTTGGTT TGGAAAATTCGATCTGTCTCAGGTAATGGAGAAGGGGGAGACAGCAGTTCATTCATTCCAGTGTCTAAGC CTGTGGTTGGTGGGAACAAGAGACTGTCTGGGATGGCTCCAGCCCTTCGCTGGAATCTCGCATTGAATTC CTAGCTCCGCCCTGATCCGTGCTGAGGCGAGCAGGTGAGTGGGACGGACAGCGCTGTGCCTGCACCCTCC TAGCCCCACTTGCTTACCGCGGCCCCTGCCTTATCCCACACTGGGAAGTATGCTCTGTTAGCCTCGGCTC AGCCTTGCCTCATCGGCCCAGTGGGGAGAGTCCAGGGAGGAGAGAGGCTCCACGTGCTAAAGGAAAGCGG CCTGCCAGACACTGCTGCTTAAGGAGACTGTCTAAGCAATCGGATTCGGTGCGGCCGAGATGCAGACGTC CGTTTCTCCCAAGGGAAGGAGCAAGGGTACTCCAGGTCCCAAAGCTGCGTTACAGCCAGTTGGGCTAATC CTACCCGCCCCTCCCCCAACTCCCCGAGTGGCAATCTGTCCAGCCCCTCAAGCGATCAGGCCACAACCCC CAGCACCGCGCGTTCTCCTCCCAGCCTAGCCCGGCCCATCTCCCCACCCGGGGCCCCGCCCCGGCCCCGC AGGCTCCCAAGAGGCGGTGGATGGGCCAGCGGGACTACAAGTCCCAGCAGGCCCCGGGGCCCGCCCTCGT GGGGCGGAGCCAAGCCAGCAGCGAATTGGGAGGAGCCCTGGCGCTCAGGCTAGGGAACGCGTGTGGCCAA TCGCGGGGCCGTTCTCGCCGCGAGCCGATGGGGGCGGGGAAAAGTCCGGCTGGGCCGGGACAAAAGCCGG ATCCCGGGAAGCTACCGGCTGCTGGGGTGCTCCGGATTTTGCGGGGTTCGTCGGGCCTGTGGAAGAAGCG CCGCGCACGGACTTCGGCAGAGGTGAGCACGGGAGGCTGTTTTCGCTGGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ACLY_1 ↗ | 17:41,918,951 | 負股 | 41,918,941–41,919,000 |
| ACLY_2 ↗ | 17:41,930,541 | 負股 | 41,930,531–41,930,590 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_8389CT · enhancer · 41914046–41914239 · regulatory
ENSR17_9LM73 · enhancer · 41914369–41914792 · regulatory
ENSR17_C66B9 · enhancer · 41917159–41918940 · regulatory
ENSR17_BBBLN · promoter · 41918941–41919512 · regulatory
· motif · 41914333–41914348 · motif
· motif · 41917339–41917350 · motif
· motif · 41917340–41917351 · motif
· motif · 41918543–41918556 · motif
· motif · 41918799–41918810 · motif
· motif · 41918925–41918942 · motif
· motif · 41919002–41919012 · motif
· motif · 41919189–41919199 · motif
· motif · 41919305–41919315 · motif
· motif · 41919310–41919320 · motif
· motif · 41919374–41919387 · motif
· motif · 41919374–41919387 · motif
· motif · 41919474–41919483 · motif
· motif · 41919474–41919483 · motif
· motif · 41920225–41920238 · motif
· motif · 41920225–41920238 · motif
· motif · 41922395–41922411 · motif
· motif · 41922498–41922514 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1101 aa
ATP citrate lyase 長 1101 個胺基酸，N 端第 4–265 位註解有 ATP-grasp 結構域；第 441–487 位為預測的無序區段。N 端區段屬於 succinate/malate CoA ligase beta subunit family，C 端區段屬於 succinate/malate CoA ligase alpha subunit family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ATP citrate lyase 位於細胞質與細胞質基質。 來源未提供定位隨條件改變或異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
ATP citrate lyase 形成同源四聚體。來源未列出其他結合夥伴或與其他蛋白質形成複合體的資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ATP citrate lyase 催化 citrate 裂解，生成 oxaloacetate 與 acetyl-CoA；其中 acetyl-CoA 可作為蛋白質、醣類及脂質代謝中多種生化反應共用的基質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Catalyzes the cleavage of citrate into oxaloacetate and acetyl-CoA, the latter serving as common substrate in multiple biochemical reactions in protein, carbohydrate and lipid metabolism PMID 10653665 ↗ · PMID 1371749 ↗ · PMID 19286649 ↗ · PMID 23932781 ↗ · PMID 39881208 ↗ · PMID 9116495 ↗ |
| 分子活性 | oxaloacetate + acetyl-CoA + ADP + phosphate = citrate + ATP + CoA | 含實驗來源 | 證據與來源oxaloacetate + acetyl-CoA + ADP + phosphate = citrate + ATP + CoA PMID 10653665 ↗ · PMID 1371749 ↗ · PMID 19286649 ↗ · PMID 23932781 ↗ · PMID 9116495 ↗ |
| 交互作用 | Homotetramer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ATP citrate lyase 位於細胞質與細胞質基質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCTGGGGTGCTCCGGATTTTGCGGGGTTCGTCGGGCCTGT40GGAAGAAGCGCCGCGCACGGACTTCGGCAGAGGTAGAGCA80GGTCTCTCTGCAGCCATGTCGGCCAAGGCAATTTCAGAGC120AGACGGGCAAAGAACTCCTTTACAAGTTCATCTGTACCAC160CTCAGCCATCCAGAATCGGTTCAAGTATGCTCGGGTCACT200CCTGACACAGACTGGGCCCGCTTGCTGCAGGACCACCCCT240GGCTGCTCAGCCAGAACTTGGTAGTCAAGCCAGACCAGCT280GATCAAACGTCGTGGAAAACTTGGTCTCGTTGGGGTCAAC320CTCACTCTGGATGGGGTCAAGTCCTGGCTGAAGCCACGGC360TGGGACAGGAAGCCACAGTTGGCAAGGCCACAGGCTTCCT400CAAGAACTTTCTGATCGAGCCCTTCGTCCCCCACAGTCAG440GCTGAGGAGTTCTATGTCTGCATCTATGCCACCCGAGAAG480GGGACTACGTCCTGTTCCACCACGAGGGGGGTGTGGACGT520GGGTGATGTGGACGCCAAGGCCCAGAAGCTGCTTGTTGGC560GTGGATGAGAAACTGAATCCTGAGGACATCAAAAAACACC600TGTTGGTCCACGCCCCTGAAGACAAGAAAGAAATTCTGGC640CAGTTTTATCTCCGGCCTCTTCAATTTCTACGAGGACTTG680TACTTCACCTACCTCGAGATCAATCCCCTTGTAGTGACCA720AAGATGGAGTCTATGTCCTTGACTTGGCGGCCAAGGTGGA760CGCCACTGCCGACTACATCTGCAAAGTGAAGTGGGGTGAC800ATCGAGTTCCCTCCCCCCTTCGGGCGGGAGGCATATCCAG840AGGAAGCCTACATTGCAGACCTCGATGCCAAAAGTGGGGC880AAGCCTGAAGCTGACCTTGCTGAACCCCAAAGGGAGGATC920TGGACCATGGTGGCCGGGGGTGGCGCCTCTGTCGTGTACA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。