基因總覽
ACKR5（atypical chemokine receptor 5）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 G protein-coupled receptor 1 family，為一種非典型趨化因子受體。它能結合多種趨化因子，來源列出的配體涵蓋 CXC、CC 與 XC 趨化因子配體家族。與典型的配體誘發訊號受體不同，ACKR5 的主要角色是調節趨化因子的量與所在位置，而非啟動傳統訊號路徑。蛋白質具有多次穿膜的結構，並在細胞膜與胞內體膜之間移動；這些特性與其處理趨化因子的作用相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000300098 ★ | 56,994,492–56,998,447 | 2 |
| ENST00000885415 | 56,994,487–56,998,447 | 2 |
| ENST00000956655 | 56,994,487–56,998,889 | 3 |
| ENST00001143417 | 56,994,487–56,998,877 | 2 |
| ENST00000556850 | 56,996,259–56,998,441 | 2 |
| ENST00000622922 | 56,996,961–56,997,551 | 1 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ACKR5 透過結合趨化因子，調節這些分子的量與分布。此受體不依賴典型的配體誘發訊號路徑來發揮作用；來源特別指出，它不以 G protein 活化或 Ca(2+) 動員等方式傳遞這類訊號。相對地，ACKR5 可使趨化因子被截留、運送或內化，進而控制其可用性。
它可清除多種趨化因子，涵蓋 CXC、CC 與 XC 家族；來源列出的例子包括 CXCL9、CXCL10、CXCL12、CXCL13、CXCL11、CXCL14、CCL1、CCL11、CCL19、CCL25、CCL28 與 XCL1。就 CXCL13 和 CCL28 而言，ACKR5 被指出是其唯一的非典型受體。
ACKR5 與 beta-arrestins 有強烈且持續存在的關聯，這項關聯不需配體結合，並且對受體的細胞內運輸及趨化因子清除至關重要。ACKR5 也與 ACKR3、ACKR4 協同調節血清中的趨化因子濃度：ACKR3 對應 CXCL12，ACKR4 對應 CCL19。來源另依相似性指出 ACKR5 是細胞免疫的重要調節因子；此項描述屬 By similarity，並非此處所列的直接實驗證據。
Promoter 與基因調控
>ACKR5 ENST00000300098 GRCh38 chr12:56993492-56994592 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGGGTATCTCCAGAATCCAACGAGATGAAGTGAGGTGAAAGCGCTCTGAAGGGCAGGAAGCTCTGCTGA CACAAAATGTTTACCCATAACACGTGGCTTAGAGTCCCTTACCCTCTAGCTTGGCGGGAGAGAGAAGTCT GCTCTCCCTACCCCACGCCCCATCCCCTGCTCATCCCCTGCCAGCCACCCACCACACCCTTCACGCAGAG AAGTATAGAGCCACAGGGGGAGGGCGCCATTCTCTCTCTCCCTCCCTACTCAGGAATCTCCCTGAAGCTT TGACAAAGCCCCCTTGACACCCCGCATTCAATCTTATTTTTATTTTTTTTTATTAACTCTGTCACCTAGG CTGGAGTGCAGTGACCTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCTCAAGCGATTCTCCTGCCT CAGCCTCTCAAAATGCTGGAATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCAGCCATTCAATCTTTTCTTTCCCAG ATTCTCACCTCCAATCACAAGATGAAGGCAGGGAGCTCACAGCCCTGTGAGGGGCTGGGGAGAATGGCAG GGGTGGGCCAGAGTTATTAAAAGCCCAACTGATGTTCAGATTTATTTTGACCCTCCCCTATACCCCCACA TCCAATTTCACTCTAGTAGGAATCAAGACAGGGGAGAGAGGGATTCCAAGCTGACTTAGGGAGAGGAAAA TACATACATACGTAAAGCATTTGCCACAGGCCCCACCTGAGCTAAGCACTTTCCCTCCCTCAACAGCTCC TTTAATTCTCAAAGCATCCCTTTTAGTAGATAATAGACCCCACTTTGCAGAGGAGAGCACTGAGGCTGAG GAAAGAGGTAAATTCATTCAGCGGGTGAGGGAGGAGCTGGGATTTTAATGCTGGCAGTATGACCTCCCCG CCACTGGCACACCGGGTCTTTTGCTGGGACATCCCCTGTAACCGGATTGGGGGAATGCAGGAAAAACCCC ATCCCTCCCTACAGAGCCTCAGCAGTGACAGCTACTTCCCGGATGAGAAGGGCGGCCGTGAAGCCAGCAG GGAAGCCAGCCCCACAGCCAAGGGCCCCCCAGCCTCCTCACAGCTCCCCAT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GPR182_1 ↗ | 12:56,994,492 | 正股 | 56,994,443–56,994,502 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_BFBDB · enhancer · 56991412–56991957 · regulatory
ENSR12_83N8NL · enhancer · 56999033–56999245 · regulatory
· motif · 56991399–56991409 · motif
· motif · 56991566–56991576 · motif
· motif · 56991670–56991683 · motif
· motif · 56998933–56998944 · motif
· motif · 56998934–56998945 · motif
· motif · 56999166–56999182 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：404 aa
ACKR5 蛋白長 404 個胺基酸，屬於 G protein-coupled receptor 1 family。序列註解預測其具有七段螺旋狀穿膜區，位置分別為 58–79、91–113、128–149、171–193、218–239、259–280 與 300–320。胞外區段分布於穿膜區之間，胞質區段則包括 80–90、150–170、240–258 及 321–404。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ACKR5 位於細胞膜及胞內體膜，並會在質膜與胞內體之間自發移動；此運輸過程依賴 beta-arrestin。 來源未提供不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- RAMP1O60894 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RAMP2O60895 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP3O60896 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ACKR5 與 beta-arrestins 有強烈且持續存在的關聯，並促使 ACKR5 及其配體內化。來源描述的是受體與 beta-arrestins 的關聯及其內化結果，未指出特定複合體組成；因此不將此功能關係延伸為其他分子間的實體結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ACKR5 是非典型趨化因子受體，藉由結合、截留、運送或內化多種趨化因子來調節其含量、位置與可用性，不依賴 G protein 活化或 Ca(2+) 動員等典型配體誘發訊號。它可清除 CXC、CC、XC 家族配體；CXCL13 與 CCL28 的非典型受體中僅有 ACKR5。其與 beta-arrestins 的持續關聯不依賴配體結合，並支持受體運輸及趨化因子清除；另與 ACKR3、ACKR4 協同調節血清 CXCL12、CCL19。其細胞免疫調節作用標示為 By similarity。 | 含實驗來源 | 證據與來源Atypical chemokine receptor that regulates chemokine levels and localization through chemokine binding, independently of activating classical ligand-induced signaling pathways such as G protein activation and Ca(2+) mobilization. Instead, it mediates chemokine sequestration, transport, or internalization to control their availability. Acts as a scavenger for a broad range of chemokines from CXC, CC and XC chemokine ligand families including CXCL9, CXCL10, CXCL12, CXCL13, CXCL11, CXCL14, CCL1, CCL11, CCL19, CCL25, CCL28 and XCL1. Is the only atypical receptor for chemokines CXCL13 and CCL28. Has a strong constitutive association with beta-arrestins, which is essential for intracellular receptor trafficking and chemokine scavenging, and occurs independently of ligand binding. Cooperates with ACKR3 and ACKR4 in regulating serum levels of CXCL12 and CCL19, respectively. Acts as an important modulator of cellular immunity (By similarity) PMID 33875597 ↗ · PMID 35013216 ↗ · PMID 37554323 ↗ · PMID 38026988 ↗ |
| 交互作用 | ACKR5 與 beta-arrestins 有強烈且持續存在的關聯，並導致 ACKR5 及其配體內化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Strong constitutive association with beta-arrestins; leading to internalization of ACKR5 and its ligands PMID 33875597 ↗ · PMID 37554323 ↗ |
| 細胞定位 | ACKR5 是多次穿膜蛋白，位於細胞膜及胞內體膜，並以依賴 beta-arrestin 的方式在質膜與胞內體之間自發運輸。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Spontaneously traffic between the plasma membrane and endosomes, in a beta-arrestin-dependent manner PMID 37554323 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGCAGTGACAGCTACTTCCCGGATGAGAAGGGCGGCCGTG40AAGCCAGCAGGGAAGCCAGCCCCACAGCCAAGGGCCCCCC80AGCCTCCTCACAGCTCCCCATAGCCTGGACCTGCCGGCCC120TCCCTCCAGGACCGAGGGGCTCCCAAGGGAAACTCAGGCG160TGTGCTGGTCCCAATGTCAGTGAAACCCAGCTGGGGGCCT200GGCCCCTCGGAGGGGGTCACCGCAGTGCCTACCAGTGACC240TTGGAGAGATCCACAACTGGACCGAGCTGCTTGACCTCTT280CAACCACACTTTGTCTGAGTGCCACGTGGAGCTCAGCCAG320AGCACCAAGCGCGTGGTCCTCTTTGCCCTCTACCTGGCCA360TGTTTGTGGTTGGGCTGGTGGAGAACCTCCTGGTGATATG400CGTCAACTGGCGCGGCTCAGGCCGGGCAGGGCTGATGAAC440CTCTACATCCTCAACATGGCCATCGCGGACCTGGGCATTG480TCCTGTCTCTGCCCGTGTGGATGCTGGAGGTCACGCTGGA520CTACACCTGGCTCTGGGGCAGCTTCTCCTGCCGCTTCACT560CACTACTTCTACTTTGTCAACATGTATAGCAGCATCTTCT600TCCTGGTGTGCCTCAGTGTCGACCGCTATGTCACCCTCAC640CAGCGCCTCCCCCTCCTGGCAGCGTTACCAGCACCGAGTG680CGGCGGGCCATGTGTGCAGGCATCTGGGTCCTCTCGGCCA720TCATCCCGCTGCCTGAGGTGGTCCACATCCAGCTGGTGGA760GGGCCCTGAGCCCATGTGCCTCTTCATGGCACCTTTTGAA800ACGTACAGCACCTGGGCCCTGGCGGTGGCCCTGTCCACCA840CCATCCTGGGCTTCCTGCTGCCCTTCCCTCTCATCACAGT880CTTCAATGTGCTGACAGCCTGCCGGCTGCGGCAGCCAGGA920CAACCCAAGAGCCGGCGCCACTGCCTGCTGCTGTGCGCCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。