演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ACHEYT

acetylcholinesterase (Yt blood group)

ACHE 編碼 acetylcholinesterase (Yt blood group),其主要作用是在神經肌肉接點分解 acetylcholine,協助終止訊號傳遞;來源亦指出它與神經元凋亡有關。

Homo sapiens7q22.1UniProt P22303
OFFICIAL SYMBOL
ACHE
CHROMOSOME
7
UNIPROT
P22303
PDB / ALPHAFOLD
1F8U
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ACHE 是蛋白質編碼基因,產物為 Acetylcholinesterase,屬於 type-B carboxylesterase/lipase family。其蛋白質長 614 個胺基酸,序列註解包含位於第 1 至 31 個胺基酸的訊號胜肽。資料指出此蛋白質具有多種異構型,並可形成不同組成或錨定形式;其具體分子作用與相關生物學意義見功能說明。

Official symbol
ACHE
Gene name
acetylcholinesterase (Yt blood group)
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:108
UniProt
P22303
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
YT

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q22.1
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegACHEpq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr7:100,889,993–100,897,022
Gene span
7,030 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000241069 ★100,889,994–100,895,8885
ENST00000419336100,889,994–100,895,9715
ENST00000428317100,889,994–100,896,1295
ENST00000412389100,889,994–100,894,3884
ENST00000411582100,889,994–100,895,8885
ENST00000894903100,889,994–100,897,0226
ENST00000894904100,889,994–100,897,0225
ENST00000894905100,889,994–100,897,0226
ENST00000894906100,889,994–100,897,0226
ENST00000894907100,889,994–100,896,9845
ENST00000894908100,889,994–100,897,0226
ENST00000894909100,889,994–100,896,3175

顯示 12/32 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Acetylcholinesterase 的主要功能是快速水解釋放至突觸間隙的 acetylcholine。這項反應使神經肌肉接點的訊號傳遞得以終止,因而在神經訊號的收束過程中扮演作用。其催化反應為 acetylcholine 與水反應,產生 choline、acetate 及氫離子。

來源也指出 acetylcholinesterase 與神經元凋亡有關,但未進一步說明其參與方式或作用機制,因此不能據此推定它在凋亡中的具體調控方向。相關敘述限於神經元凋亡這項功能關聯。

此蛋白質可形成多種組裝形式,且不同異構型的組成有所差異;在部分形式中,催化性四聚體與錨定蛋白相連,能附著於基底板或細胞膜。這些組裝與錨定特徵提供了其在細胞表面或基底板相關位置形成不同結構的背景,但來源未指出這些形式會改變催化反應本身。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 100895888 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ACHE ENST00000241069 GRCh38 chr7:100895788-100896888 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCACCTCGGTCGTGGGGACCCCGCTGCAGCAGCCCTGTCCACACGGGTGAACTCCTGGAGGGCGGGGCGG
GGGGCAATCTGCGCGGGTCAGGCCCCTCGGAGCAGGCTGGGGGCGCCCGAGCCAGGCCGCTCCCACCTGC
CAGCCGCGTGGCCAATGAATGCTAGGCCTGGTGATGTCATGCCCCGACCGGACCCTGGTGACGAAAGTCC
GAAGTCACCCGTCAGGGAACCAGCACAGACCCACCCGCGGGGGTTCCAGAAGTTTCCACTGCCGCCGCGG
AGTGCGGCCTCGCCCAGCAGCCTTGCGCGTGCTACCACGCTGTCCTGCCTTCTCAGGTGTCCCAAGTCAC
CCCTTCCTCCCCCAGGGGTCTCCTGTCTCCATGCCCTCCCACCTCATTTCCACTAGCGATCCCATTTTAC
ATCTCCATTCCCACAGGTGTCCTTTCATCCCCAGGAGTGTCCCACGTCACCTTTTCTGCACCCGTGCCAC
CTGGACCCCTAAGGGGACGGTACTCTGCCACACTCCCACATGCCTCTCCTCCCATGCCACCCGTCTGTGT
CGTGGCCGGGGATGCATGACCCCTTGGCCTTGCGCTAACTTCACCAGCCTCGAGCGAGACCGACAGGGTG
TCCAAGTGTGTCCGTCCGTCTGTGAAAGTCGTCCCTGCGTTTGTCTGTGCCTGTCACTGCATGAGGTCGT
CCGTCTGCGCGTGTCTGTCTCCACGGGCTTCTGTCCGTCTGTCTGTCACGTGGGTGTCTACTCCGCCGCT
GCAGGTCTTTGGGTCGCGTCTGTCACTGCGCTCTGTCGTCGGTCGGCGTCTGGCACTGGAGTGCGTCTGG
GCCCCGGGGTCTCCGGGTCTCGGCTCCAAGGGAGGGAGAGAGAGGGGAGGTGGCCACCCGGGAGAGCGGG
GAGGGGCGGGGGCGGAGACAGTGGGCGGGGGCGGGCGGGGGCGCTGTGAGGCCCGGAGGGGGTGTGTGCG
GGGGGCCGGAGGCGGCGGCTGTCAGAGTCGGCTCAGCCTGCGCCGGGGAACATCGGCCGCCTCCAGCTCC
CGGCGCGGCCCGGCCCGGCCCGGCTCGGCCGCCTCAGGTGAGTCTCCCTCC
ACHE 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ACHE_1 ↗7:100,895,888負股100,895,878–100,895,937
ACHE_3 ↗7:100,896,094負股100,896,084–100,896,143
ACHE_2 ↗7:100,896,994負股100,896,984–100,897,043

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_5TPPXW · CTCF_binding_site · 100893352–100893373 · regulatory

ENSR7_93H393 · promoter · 100894378–100894878 · regulatory

ENSR7_BQ2M8 · promoter · 100895876–100896619 · regulatory

ENSR7_5TPQM4 · CTCF_binding_site · 100897281–100897302 · regulatory

ENSR7_77X76P · enhancer · 100897620–100897732 · regulatory

ENSR7_93H3B2 · enhancer · 100897859–100898150 · regulatory

ENSR7_5TPQQP · CTCF_binding_site · 100898068–100898089 · regulatory

· motif · 100890966–100890975 · motif

· motif · 100891141–100891156 · motif

· motif · 100893354–100893370 · motif

· motif · 100895366–100895379 · motif

· motif · 100895610–100895623 · motif

· motif · 100895934–100895947 · motif

· motif · 100895944–100895957 · motif

· motif · 100895963–100895976 · motif

· motif · 100896102–100896117 · motif

· motif · 100896298–100896313 · motif

· motif · 100896304–100896316 · motif

· motif · 100896306–100896313 · motif

· motif · 100896308–100896324 · motif

· motif · 100896494–100896507 · motif

· motif · 100896707–100896720 · motif

· motif · 100896707–100896720 · motif

· motif · 100897283–100897299 · motif

· motif · 100898070–100898086 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:614 aa

1 aa614 aa訊號胜肽
依 P22303 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Acetylcholinesterase 為 614 個胺基酸的蛋白質,屬於 type-B carboxylesterase/lipase family。序列註解預測其訊號胜肽位於第 1 至 31 個胺基酸;來源未提供其他結構域或功能區域的序列註解。

訊號胜肽1–31 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1F8U…

PDB · 1F8U

X-ray · 2.90 A · A=32-614

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Synapse;Secreted;Cell membrane;Nucleus

來源列出此蛋白質與突觸、分泌形式及細胞膜周邊定位相關。 異構型 T 僅在凋亡細胞核中觀察到;異構型 H 則以 GPI 錨定方式位於細胞膜外側。 這些描述涉及不同形式,不能視為所有異構型共有的定位。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

未繪示構造:Synapse。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
YTACHECOLQENO1RACK1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源指出 ACHE 與 PRIMA1 互作;依相似性推定,此互作是其錨定至細胞基底板並組成四聚體所必需。異構型 H 可形成以二硫鍵連結的 GPI 錨定二聚體。異構型 T 可呈單體、二聚體、膠原尾或疏水尾形式;其中催化性四聚體可與錨定蛋白相連。膠原尾形式中的異構型 T 次單元與 COLQ 結合,COLQ 會促成四聚體由單體或二聚體形成。異構型 R 則可能為單體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Acetylcholinesterase 會快速水解釋放至突觸間隙的 acetylcholine,使神經肌肉接點的訊號傳遞終止;來源另指出此蛋白質與神經元凋亡有關,但未說明該關聯的具體機制。含實驗來源
證據與來源

Hydrolyzes rapidly the acetylcholine neurotransmitter released into the synaptic cleft allowing to terminate the signal transduction at the neuromuscular junction. Role in neuronal apoptosis

PMID 11985878 ↗ · PMID 1517212 ↗ · PMID 1748670 ↗ · PMID 2714437 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性acetylcholine + H2O = choline + acetate + H(+)含實驗來源
證據與來源

acetylcholine + H2O = choline + acetate + H(+)

PMID 1517212 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ACHE 與 PRIMA1 互作;依相似性推定,此互作對基底板錨定及四聚體組成必要。異構型 H 形成二硫鍵連結的 GPI 錨定二聚體;異構型 T 可形成多種單體、二聚體及尾部結構,並可與 COLQ 或錨定蛋白組裝;異構型 R 可能為單體。含實驗來源
證據與來源

Interacts with PRIMA1. The interaction with PRIMA1 is required to anchor it to the basal lamina of cells and organize into tetramers (By similarity). Isoform H generates GPI-anchored dimers; disulfide linked. Isoform T generates multiple structures, ranging from monomers and dimers to collagen-tailed and hydrophobic-tailed forms, in which catalytic tetramers are associated with anchoring proteins that attach them to the basal lamina or to cell membranes. In the collagen-tailed forms, isoform T subunits are associated with a specific collagen, COLQ, which triggers the formation of isoform T tetramers, from monomers and dimers. Isoform R may be monomeric

PMID 11053835 ↗ · PMID 15526038 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位來源將此蛋白質定位於突觸,並列出分泌形式及細胞膜周邊蛋白質定位;該項資料未進一步區分這些位置對應的異構型。含實驗來源
證據與來源

Synapse; Secreted; Cell membrane / Peripheral membrane protein

PMID 11985878 ↗ · PMID 1748670 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位異構型 T 曾在細胞核中觀察到,但此定位僅見於凋亡細胞核;來源沒有提供其他細胞狀態下核定位的資訊。資料庫紀錄
證據與來源

Isoform T; Nucleus; Only observed in apoptotic nuclei

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位異構型 H 以脂質錨定方式定位於細胞膜,並由 GPI 錨定於細胞膜外側;此定位描述限於異構型 H。推論支持
證據與來源

Isoform H; Cell membrane / Lipid-anchor, GPI-anchor / Extracellular side

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000241069 · 2,172 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTCAGAGTCGGCTCAGCCTGCGCCGGGGAACATCGGCCGC40
41CTCCAGCTCCCGGCGCGGCCCGGCCCGGCCCGGCTCGGCC80
81GCCTCAGACGCCGCCTGCCCTGCAGCCATGAGGCCCCCGC120
121AGTGTCTGCTGCACACGCCTTCCCTGGCTTCCCCACTCCT160
161TCTCCTCCTCCTCTGGCTCCTGGGTGGAGGAGTGGGGGCT200
201GAGGGCCGGGAGGATGCAGAGCTGCTGGTGACGGTGCGTG240
241GGGGCCGGCTGCGGGGCATTCGCCTGAAGACCCCCGGGGG280
281CCCTGTCTCTGCTTTCCTGGGCATCCCCTTTGCGGAGCCA320
321CCCATGGGACCCCGTCGCTTTCTGCCACCGGAGCCCAAGC360
361AGCCTTGGTCAGGGGTGGTAGACGCTACAACCTTCCAGAG400
401TGTCTGCTACCAATATGTGGACACCCTATACCCAGGTTTT440
441GAGGGCACCGAGATGTGGAACCCCAACCGTGAGCTGAGCG480
481AGGACTGCCTGTACCTCAACGTGTGGACACCATACCCCCG520
521GCCTACATCCCCCACCCCTGTCCTCGTCTGGATCTATGGG560
561GGTGGCTTCTACAGTGGGGCCTCCTCCTTGGACGTGTACG600
601ATGGCCGCTTCTTGGTACAGGCCGAGAGGACTGTGCTGGT640
641GTCCATGAACTACCGGGTGGGAGCCTTTGGCTTCCTGGCC680
681CTGCCGGGGAGCCGAGAGGCCCCGGGCAATGTGGGTCTCC720
721TGGATCAGAGGCTGGCCCTGCAGTGGGTGCAGGAGAACGT760
761GGCAGCCTTCGGGGGTGACCCGACATCAGTGACGCTGTTT800
801GGGGAGAGCGCGGGAGCCGCCTCGGTGGGCATGCACCTGC840
841TGTCCCCGCCCAGCCGGGGCCTGTTCCACAGGGCCGTGCT880
881GCAGAGCGGTGCCCCCAATGGACCCTGGGCCACGGTGGGC920
921ATGGGAGAGGCCCGTCGCAGGGCCACGCAGCTGGCCCACC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。