演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ABCG8GBD4

ATP binding cassette subfamily G member 8

ABCG8 編碼 ATP binding cassette subfamily G member 8,須與 ABCG5 組成異源二聚體,參與膽固醇及其他固醇的運輸,協助維持體內固醇平衡。

Homo sapiens2p21UniProt Q9H221
OFFICIAL SYMBOL
ABCG8
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q9H221
PDB / ALPHAFOLD
7JR7
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ATP binding cassette subfamily G member 8 是 ABC transporter 超家族 ABCG 家族的蛋白質,也屬於 Eye pigment precursor importer 子家族。其長度為 673 個胺基酸,具有 ABC transporter 結構域與 ABC transmembrane type-2 結構域;序列註解顯示蛋白質含有多段跨膜區域,並有一段位於 N 端的無序區。ABCG8 的主要角色與固醇運輸相關,但需與 ABCG5 配對形成異源二聚體才能執行相關運輸功能。

Official symbol
ABCG8
Gene name
ATP binding cassette subfamily G member 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13887
UniProt
Q9H221
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
GBD4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22p21
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegABCG8pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:43,831,942–43,882,988
Gene span
51,047 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000272286 ★43,838,971–43,882,98813
ENST0000064461143,831,942–43,873,9299
ENST0000088189243,838,398–43,882,98812
ENST0000088189343,838,398–43,882,98813
ENST0000088189443,838,398–43,882,98811
ENST0000088189543,838,398–43,882,98813
ENST0000088189643,838,398–43,882,98813
ENST0000088189743,838,398–43,882,98812
ENST0000088189843,838,398–43,882,98810
ENST0000088189943,838,398–43,882,98813
ENST0000088190043,838,398–43,882,98813
ENST0000088190143,838,398–43,882,98811

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ABCG8 與 ABCG5 組成必需的異源二聚體,透過依賴 Mg(2+) 與 ATP 的方式運輸固醇。此運輸作用參與腸道上皮細胞對膳食膽固醇的選擇性輸入與輸出,也參與肝臟將固醇選擇性排入膽汁。這些作用共同支持正常的固醇恆定。

該異源二聚體具有 ATPase 活性。反應註解將膽固醇或 sitosterol 的向外運輸分別表示為消耗 ATP 與水,並產生 ADP、磷酸及 H(+);這些條目描述的是反應方向與化學計量,並未提供其他底物或運輸條件的細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 43838971 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ABCG8 ENST00000272286 GRCh38 chr2:43837971-43839071 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGGAAGGCAAAGGCAGCTTGGGGCCCTGGAAGGGGCCACACCCAGGTCCCCAGCATTGATCCTACCTGT
GCCCCACCCCAGTAGTCTCCGGACAGGCTCCTAACGTGTTTCAGTCTCTGCGCCCTCCTCTGTAGAACCT
GGCAGATAGCGACTGAGGCTGTCTGCCACGTAGGGAGGGGGCCTGTGCTGGAGTTGCTCTGAATGTCCTG
TCCGTTTGGCTGCGAGGTGGCTGTCCCTGCATTCTTTCACCAGGTTTCAAGACTCCTTGCATTCGCAGTA
CCCCCATTCCCATCCACAGAGGGCAGGCCGTAGACACTGGGTTGGCAGGGCACTGCTGCCACTTTGTTTA
TGCCCAGGCCCTTCCCTGGGCAGGGGGAGGGGCCATTCACTGTCGCTCCATGTTTCCCAGCACAGCCCTT
CTCCCTCTCCTCTCTCCACCCGATCCACTAAAGAGGGAGCCCGAAGTGCCCAGACTGGCACTTAAAGAGT
GAAGAAAGGCAGCAGAGGGGTGAGCGCCGGGCCCCGCACTCCTGGGGGAGCAGCAGCAGCAAGGGCTCTG
CCTTACCTGACGCTGTAGGAGGCATGGAGGATGCCCAGGCTGTGAGGCTCCGGGGCGGTGGCAGGAGCCC
CCTCCAGGGAGCTCTGGGAGCCTCTGTTTACTTGGAGACCCATGGACCCTCCGGGGGTCAAAGATGAGAG
GTCACCCATGGCCAACAGGCAGCAAAGCTGGGCAAATTTTCTGGTGGCCGGACCCTCCCCAGAGTGGCTT
CAGTTGGGGAGCCCGTGGCAGACTGCCCTGCCTGCTCCACCTGACCCCGGAGTCCCTTGGGACAGCAGGA
CTGGGACTTGGCCACGGAGACCATTATCTGATGTACCTTTAGCCAGCGCGTCCTTATCTTGACAGTGGGC
AGAACACACACGTTTGTAGGTGGGCTTGCCAGCAAGGAATGCTGGGAGAGACGGGCCCAGGGCAGGAGGC
CGAGGTGTCCCTGCTCCAGGAAACAGAGTGAAGACACTGGCCCTGGCAGGCAGCAGCTGGGTCTAAGAGA
GCTGCAGCCCAGGGTCACAGACCTGTGGGCCCCATGGCCGGGAAGGCGGCA
ABCG8 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ABCG8_1 ↗2:43,838,975正股43,838,926–43,838,985

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 43834715–43834729 · motif

· motif · 43834858–43834873 · motif

· motif · 43834858–43834873 · motif

· motif · 43838654–43838667 · motif

· motif · 43838661–43838674 · motif

· motif · 43838721–43838731 · motif

· motif · 43839260–43839273 · motif

· motif · 43839307–43839320 · motif

· motif · 43842331–43842345 · motif

· motif · 43842331–43842345 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:673 aa

1 aa673 aa結構域功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q9H221 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ABCG8 為 673 個胺基酸的 ABC transporter,含 ABC transporter 結構域(胺基酸 47–313)及 ABC transmembrane type-2 結構域(411–665)。序列註解標示六段螺旋跨膜區域,分布於多個細胞質區段與短胞外區段之間;N 端 1–25 被標註為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–416 aa
跨膜區Helical; Name=1417–437 aa
拓樸區域Extracellular438–447 aa
跨膜區Helical; Name=2448–468 aa
拓樸區域Cytoplasmic469–497 aa
跨膜區Helical; Name=3498–518 aa
拓樸區域Extracellular519–527 aa
跨膜區Helical; Name=4528–548 aa
拓樸區域Cytoplasmic549–555 aa
跨膜區Helical; Name=5556–576 aa
拓樸區域Extracellular577–639 aa
跨膜區Helical; Name=6640–660 aa
拓樸區域Cytoplasmic661–673 aa
結構域ABC transporter47–313 aa
結構域ABC transmembrane type-2411–665 aa
功能區域Disordered1–25 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7JR7…

PDB · 7JR7

EM · 3.30 A · B=1-673

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Apical cell membrane

ABCG8 被標註為多次跨膜蛋白,位於細胞膜及頂端細胞膜。 來源未提供定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
GBD4ABCG8ABCG5MESD
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ABCG8 與 ABCG5 形成異源二聚體;此配對是來源所述固醇運輸功能的必要組成。資料未列出其他直接結合夥伴或複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ABCG8 相關變異可能與膽囊疾病 4 的易感性有關;膽固醇結石是其常見表現,但多數患者終生無症狀。這項資料描述的是易感性關聯,並非表示變異必然導致疾病。

Sitosterolemia 1 則被描述為由影響 ABCG8 的變異所致,屬常染色體隱性代謝疾病,特徵包括腸道對膽固醇、植物固醇及貝類固醇吸收失調,以及膽汁排出膳食固醇減少。患者可有高膽固醇血症、血漿植物固醇濃度極高,並常見肌腱與結節狀黃瘤、加速性動脈粥樣硬化及早發冠狀動脈疾病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ABCG5 與 ABCG8 必須形成異源二聚體,並以依賴 Mg(2+) 和 ATP 的方式跨細胞膜運輸固醇。此作用參與腸道上皮細胞對膳食膽固醇的選擇性輸入與輸出,以及肝臟將固醇選擇性排入膽汁,並為正常固醇恆定所需。該異源二聚體具有 ATPase 活性。含實驗來源
證據與來源

ABCG5 and ABCG8 form an obligate heterodimer that mediates Mg(2+)- and ATP-dependent sterol transport across the cell membrane. Plays an essential role in the selective transport of the dietary cholesterol in and out of the enterocytes and in the selective sterol excretion by the liver into bile. Required for normal sterol homeostasis. The heterodimer with ABCG5 has ATPase activity

PMID 11099417 ↗ · PMID 11452359 ↗ · PMID 15054092 ↗ · PMID 16893193 ↗ · PMID 27144356 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性cholesterol(in) + ATP + H2O = cholesterol(out) + ADP + phosphate + H(+)推論支持
證據與來源

cholesterol(in) + ATP + H2O = cholesterol(out) + ADP + phosphate + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性sitosterol(in) + ATP + H2O = sitosterol(out) + ADP + phosphate + H(+)推論支持
證據與來源

sitosterol(in) + ATP + H2O = sitosterol(out) + ADP + phosphate + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ABCG8 與 ABCG5 形成異源二聚體。含實驗來源
證據與來源

Heterodimer with ABCG8

PMID 16893193 ↗ · PMID 20210363 ↗ · PMID 27144356 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ABCG8 被標註為多次跨膜蛋白,定位於細胞膜及頂端細胞膜。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 16893193 ↗ · PMID 27144356 ↗ · PMID 14504269 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯膽囊疾病 4 的常見表現為膽固醇結石,但多數患者終生沒有症狀。影響 ABCG8 的變異可能與疾病易感性有關;此處描述的是關聯,而非變異必然造成疾病。含實驗來源
證據與來源

Gallbladder disease 4 GBD4 One of the major digestive diseases. Gallstones composed of cholesterol (cholelithiasis) are the common manifestations in western countries. Most people with gallstones, however, remain asymptomatic through their lifetimes. Disease susceptibility may be associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 611465

PMID 17632509 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Sitosterolemia 1 是常染色體隱性代謝疾病,與影響 ABCG8 的變異有關。其特徵為腸道對膽固醇、植物固醇及貝類固醇吸收失調,且膳食固醇經膽汁排出減少;患者可有高膽固醇血症及極高血漿植物固醇,並常出現肌腱與結節狀黃瘤、加速性動脈粥樣硬化及早發冠狀動脈疾病。含實驗來源
證據與來源

Sitosterolemia 1 STSL1 A form of sitosterolemia, an autosomal recessive metabolic disorder characterized by unregulated intestinal absorption of cholesterol, phytosterols and shellfish sterols, and decreased biliary excretion of dietary sterols into bile. Patients have hypercholesterolemia, very high levels of plant sterols in the plasma, and frequently develop tendon and tuberous xanthomas, accelerated atherosclerosis and premature coronary artery disease. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 210250

PMID 11099417 ↗ · PMID 11452359 ↗ · PMID 15054092 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000272286 · 7,180 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AAACAGAGTGAAGACACTGGCCCTGGCAGGCAGCAGCTGG40
41GTCTAAGAGAGCTGCAGCCCAGGGTCACAGACCTGTGGGC80
81CCCATGGCCGGGAAGGCGGCAGAGGAGAGAGGGCTGCCGA120
121AAGGGGCCACTCCCCAGGATACCTCGGGCCTCCAGGATAG160
161ATTGTTCTCCTCTGAAAGTGACAACAGCCTGTACTTCACC200
201TACAGTGGCCAGCCCAACACCCTGGAGGTCAGAGACCTCA240
241ACTACCAGGTGGACCTGGCCTCTCAGGTCCCTTGGTTTGA280
281GCAGCTGGCTCAGTTCAAGATGCCCTGGACATCTCCCAGC320
321TGCCAGAATTCTTGTGAGCTGGGCATCCAGAACCTAAGCT360
361TCAAAGTGAGAAGTGGGCAGATGCTGGCCATCATAGGGAG400
401CTCAGGTTGTGGGAGAGCCTCCTTGCTAGATGTGATCACT440
441GGCCGAGGTCACGGCGGCAAGATCAAGTCAGGCCAGATCT480
481GGATCAATGGGCAGCCCAGCTCGCCTCAGCTGGTGAGGAA520
521GTGTGTGGCCCACGTGCGCCAGCACAACCAGCTGCTCCCC560
561AACTTGACTGTGCGAGAGACCTTGGCCTTCATTGCCCAGA600
601TGCGGCTGCCCAGAACCTTCTCCCAGGCCCAGCGTGACAA640
641AAGGGTGGAGGACGTGATCGCGGAGCTGCGGCTTAGGCAG680
681TGCGCTGACACCCGCGTGGGCAACATGTACGTGCGGGGGT720
721TGTCGGGGGGTGAGCGCAGGAGAGTCAGCATTGGGGTGCA760
761GCTCCTGTGGAACCCAGGAATCCTTATTCTCGACGAACCC800
801ACCTCTGGGCTCGACAGCTTCACAGCCCACAACCTGGTGA840
841AGACCTTGTCCAGGCTGGCCAAAGGCAACCGGCTGGTGCT880
881CATCTCCCTCCACCAGCCTCGCTCTGACATCTTCAGGCTG920
921TTTGATCTGGTCCTCCTGATGACGTCTGGCACCCCCATCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。