演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ABCG5STSL

ATP binding cassette subfamily G member 5

ABCG5 編碼 ATP binding cassette subfamily G member 5,與 ABCG8 組成異源二聚體,參與腸道與肝臟的膽固醇及植物固醇運輸,對維持正常固醇平衡不可或缺。

Homo sapiens2p21UniProt Q9H222
OFFICIAL SYMBOL
ABCG5
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q9H222
PDB / ALPHAFOLD
5DO7
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ABCG5 是蛋白質編碼基因,產物 ATP binding cassette subfamily G member 5 屬於 ABC transporter superfamily 的 ABCG family,並歸入 Eye pigment precursor importer 子家族。它是多次穿膜蛋白,具有 ABC transporter 結構域與 ABC transmembrane type-2 結構域;蛋白質序列的 N 端另有一段被註記為無序區。ABCG5 與 ABCG8 形成必需的異源二聚體,該複合體具 ATPase 活性,並參與固醇運輸。這些家族與結構特徵構成理解其膜運輸角色的基礎。

Official symbol
ABCG5
Gene name
ATP binding cassette subfamily G member 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13886
UniProt
Q9H222
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
STSL

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22p21
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegABCG5pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:43,806,213–43,838,865
Gene span
32,653 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000405322 ★43,812,472–43,838,83913
ENST0000110804643,806,213–43,838,86513
ENST0000110804743,806,213–43,838,86514
ENST0000110804843,806,213–43,838,86512
ENST0000110804943,806,213–43,838,86512
ENST0000099776043,812,354–43,838,86512
ENST0000088211543,812,838–43,838,86513
ENST0000088211443,812,841–43,838,86511
ENST0000099776343,812,843–43,838,86511
ENST0000099776543,812,843–43,838,86512
ENST0000099776643,812,843–43,838,86513
ENST0000088211643,812,844–43,838,86511

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ABCG5 與 ABCG8 必須共同形成異源二聚體,才能介導跨細胞膜的固醇運輸。此運輸依賴 Mg(2+) 與 ATP;兩者形成的異源二聚體也具有 ATPase 活性。來源列出的反應包括將 cholesterol 或 sitosterol 由細胞內側運往外側,並伴隨 ATP 與水轉化為 ADP、磷酸鹽及 H(+);其中具體反應式的證據為相似性推定。

在腸道,ABCG5/ABCG8 參與膳食植物固醇與膽固醇進出腸上皮細胞的選擇性運輸;在肝臟,則參與將固醇選擇性排入膽汁。這些作用涉及固醇在不同方向與部位的運送,並非來源所述的單一位置或單一路徑活動。

透過上述選擇性運輸,ABCG5 與 ABCG8 對正常固醇平衡不可或缺。其功能描述涵蓋腸道對膳食固醇的處理,以及肝臟向膽汁排出固醇,呈現此複合體在固醇分布與排除上的生理意義;來源未提供更細的調控步驟或其他分子機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 43838839 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ABCG5 ENST00000405322 GRCh38 chr2:43838739-43839839 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CATCACTTCATTACTGAGACCAACCTGACAGCCACATGGATGGAGGAGACACCAGTGGAGTCCCTGGCAT
GTGTGAGCACATTTCTATGATGGAGTCTCATTCGGAAAAAGCGAAACTGGCCAGGCACGGTGGCTCATGC
CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGAGGGTGGGTAACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGCCTGACCAA
CATGGTGAAACACTGTCTCTACTAAAAAATACAAAATTTGCCAGGTGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTC
AGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATC
ACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAGAGAAGAAAAGAAAAAAGAAAAAGTGAAATTGTCCCACATCACACAAAAGAACA
TCATTTCCCTAAAAGAGCATTTCTTAGGGCAGGAAGTGACCTCAGAGGCCTCTGGGACCCTGAATCTGTT
CCCCTCCGCCCTTTGACATGCAGGAAACAGTCCTGCGGCCATGTCCTCACACTGCTTGATGTCCGGGTGG
TGCTAGGACAGAAGGCTCCTGAGGGAAGAGAGAAAGGTTTGATTTCTCCTACCCGCCCACCAGGCCTGGG
CCGACTTCCCATTGCTCACTCACCGAGGTATCCTGGGGAGTGGCCCCTTTCGGCAGCCCTCTCTCCTCTG
CCGCCTTCCCGGCCATGGGGCCCACAGGTCTGTGACCCTGGGCTGCAGCTCTCTTAGACCCAGCTGCTGC
CTGCCAGGGCCAGTGTCTTCACTCTGTTTCCTGGAGCAGGGACACCTCGGCCTCCTGCCCTGGGCCCGTC
TCTCCCAGCATTCCTTGCTGGCAAGCCCACCTACAAACGTGTGTGTTCTGCCCACTGTCAAGATAAGGAC
GCGCTGGCTAAAGGTACATCAGATAATGGTCTCCGTGGCCAAGTCCCAGTCCTGCTGTCCCAAGGGACTC
CGGGGTCAGGTGGAGCAGGCAGGGCAGTCTGCCACGGGCTCCCCAACTGAA
ABCG5 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ABCG5_1 ↗2:43,838,839負股43,838,829–43,838,888
ABCG5_2 ↗2:43,839,258負股43,839,248–43,839,307

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 43834715–43834729 · motif

· motif · 43834858–43834873 · motif

· motif · 43834858–43834873 · motif

· motif · 43838654–43838667 · motif

· motif · 43838661–43838674 · motif

· motif · 43838721–43838731 · motif

· motif · 43839260–43839273 · motif

· motif · 43839307–43839320 · motif

· motif · 43842331–43842345 · motif

· motif · 43842331–43842345 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:651 aa

1 aa651 aa結構域功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q9H222 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ATP binding cassette subfamily G member 5 長 651 個胺基酸,包含 ABC transporter 結構域及 ABC transmembrane type-2 結構域。其膜區由六段螺旋跨膜區構成;註解亦將部分區域標示為細胞質側或細胞外側。序列第 1–32 位被註記為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–383 aa
跨膜區Helical; Name=1384–404 aa
拓樸區域Extracellular405–421 aa
跨膜區Helical; Name=2422–442 aa
拓樸區域Cytoplasmic443–467 aa
跨膜區Helical; Name=3468–489 aa
拓樸區域Extracellular490–500 aa
跨膜區Helical; Name=4501–521 aa
拓樸區域Cytoplasmic522–528 aa
跨膜區Helical; Name=5529–549 aa
拓樸區域Extracellular550–623 aa
跨膜區Helical; Name=6624–644 aa
拓樸區域Cytoplasmic645–651 aa
結構域ABC transporter52–293 aa
結構域ABC transmembrane type-2388–645 aa
功能區域Disordered1–32 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5DO7…

PDB · 5DO7

X-ray · 3.93 A · A/C=1-651

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Apical cell membrane

ABCG5 被註記位於細胞膜,也包括頂端細胞膜;其為多次穿膜蛋白。 來源沒有說明不同定位出現的條件或定位是否隨狀態改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
STSLABCG5ABCG8NCK1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ABCG5 與 ABCG8 形成異源二聚體,這是來源明確指出的亞基關係。該異源二聚體具有 ATPase 活性並執行固醇運輸;這些描述屬於複合體功能,來源未另列其他直接結合夥伴。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ABCG5 相關變異會造成 Sitosterolemia 2(STSL2),屬常染色體隱性代謝疾病。其特徵包括腸道對膽固醇、植物固醇與貝類固醇吸收失去調節,以及膳食固醇經膽汁排出的量減少。患者可有高膽固醇血症及血漿植物固醇顯著升高,並常見肌腱與結節性黃瘤;也可能出現加速的動脈粥樣硬化及早發冠狀動脈疾病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ABCG5 與 ABCG8 必須形成異源二聚體,並以 Mg(2+) 與 ATP 依賴方式介導跨細胞膜固醇運輸。此複合體參與膳食植物固醇和膽固醇進出腸上皮細胞的選擇性運輸,也參與肝臟將固醇選擇性排入膽汁;這些作用對維持正常固醇平衡不可或缺,且異源二聚體具有 ATPase 活性。含實驗來源
證據與來源

ABCG5 and ABCG8 form an obligate heterodimer that mediates Mg(2+)- and ATP-dependent sterol transport across the cell membrane. Plays an essential role in the selective transport of dietary plant sterols and cholesterol in and out of the enterocytes and in the selective sterol excretion by the liver into bile. Required for normal sterol homeostasis. The heterodimer with ABCG8 has ATPase activity

PMID 11138003 ↗ · PMID 15054092 ↗ · PMID 16893193 ↗ · PMID 20210363 ↗ · PMID 27144356 ↗ · PMID 11590207 ↗ · PMID 11099417 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性cholesterol(in) + ATP + H2O = cholesterol(out) + ADP + phosphate + H(+)推論支持
證據與來源

cholesterol(in) + ATP + H2O = cholesterol(out) + ADP + phosphate + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性sitosterol(in) + ATP + H2O = sitosterol(out) + ADP + phosphate + H(+)推論支持
證據與來源

sitosterol(in) + ATP + H2O = sitosterol(out) + ADP + phosphate + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ABCG5 與 ABCG8 形成異源二聚體。含實驗來源
證據與來源

Heterodimer with ABCG8

PMID 16893193 ↗ · PMID 20210363 ↗ · PMID 27144356 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ABCG5 位於細胞膜,亦定位於頂端細胞膜;來源將其描述為多次穿膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 16893193 ↗ · PMID 27144356 ↗ · PMID 14504269 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯ABCG5 相關變異會造成 Sitosterolemia 2(STSL2),一種常染色體隱性代謝疾病。疾病特徵包括腸道對膽固醇、植物固醇及貝類固醇吸收失去調節,以及膳食固醇經膽汁排出減少。患者可有高膽固醇血症、血漿植物固醇極高,並常出現肌腱與結節性黃瘤、加速的動脈粥樣硬化及早發冠狀動脈疾病。含實驗來源
證據與來源

Sitosterolemia 2 STSL2 A form of sitosterolemia, an autosomal recessive metabolic disorder characterized by unregulated intestinal absorption of cholesterol, phytosterols and shellfish sterols, and decreased biliary excretion of dietary sterols into bile. Patients have hypercholesterolemia, very high levels of plant sterols in the plasma, and frequently develop tendon and tuberous xanthomas, accelerated atherosclerosis and premature coronary artery disease. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618666

PMID 11138003 ↗ · PMID 11452359 ↗ · PMID 11668628 ↗ · PMID 15054092 ↗ · PMID 35557526 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000405322 · 2,760 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGATAATGGTCTCCGTGGCCAAGTCCCAGTCCTGCTGTCC40
41CAAGGGACTCCGGGGTCAGGTGGAGCAGGCAGGGCAGTCT80
81GCCACGGGCTCCCCAACTGAAGCCACTCTGGGGAGGGTCC120
121GGCCACCAGAAAATTTGCCCAGCTTTGCTGCCTGTTGGCC160
161ATGGGTGACCTCTCATCTTTGACCCCCGGAGGGTCCATGG200
201GTCTCCAAGTAAACAGAGGCTCCCAGAGCTCCCTGGAGGG240
241GGCTCCTGCCACCGCCCCGGAGCCTCACAGCCTGGGCATC280
281CTCCATGCCTCCTACAGCGTCAGCCACCGCGTGAGGCCCT320
321GGTGGGACATCACATCTTGCCGGCAGCAGTGGACCAGGCA360
361GATCCTCAAAGATGTCTCCTTGTACGTGGAGAGCGGGCAG400
401ATCATGTGCATCCTAGGAAGCTCAGGCTCCGGGAAAACCA440
441CGCTGCTGGACGCCATGTCCGGGAGGCTGGGGCGCGCGGG480
481GACCTTCCTGGGGGAGGTGTATGTGAACGGCCGGGCGCTG520
521CGCCGGGAGCAGTTCCAGGACTGCTTCTCCTACGTCCTGC560
561AGAGCGACACCCTGCTGAGCAGCCTCACCGTGCGCGAGAC600
601GCTGCACTACACCGCGCTGCTGGCCATCCGCCGCGGCAAT640
641CCCGGCTCCTTCCAGAAGAAGGTGGAGGCCGTCATGGCAG680
681AGCTGAGTCTGAGCCATGTGGCAGACCGACTGATTGGCAA720
721CTACAGCTTGGGGGGCATTTCCACGGGTGAGCGGCGCCGG760
761GTCTCCATCGCAGCCCAGCTGCTCCAGGATCCTAAGGTCA800
801TGCTGTTTGATGAGCCAACCACAGGCCTGGACTGCATGAC840
841TGCTAATCAGATTGTCGTCCTCCTGGTGGAACTGGCTCGC880
881AGGAACCGAATTGTGGTTCTCACCATTCACCAGCCCCGTT920
921CTGAGCTTTTTCAGCTCTTTGACAAAATTGCCATCCTGAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。