演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

AASDHPPTLYS5

aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase

AASDHPPT 編碼一種磷酸泛醯巯基轉移酶,可將來自 CoA 的 4'-磷酸泛醯巯基轉移至受體蛋白的絲胺酸。

Homo sapiens11q22.3UniProt Q9NRN7
OFFICIAL SYMBOL
AASDHPPT
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q9NRN7
PDB / ALPHAFOLD
2BYD
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

AASDHPPT 是位於人類第 11 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase。其產物屬於 P-Pant transferase 超級家族中的 AcpS family,主要角色是催化蛋白質的轉譯後修飾。來源指出,此酵素的受體範圍廣泛,包含 FASN 的 acyl carrier domain;其分子作用方式與受體修飾反應詳述於功能區。

Official symbol
AASDHPPT
Gene name
aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14235
UniProt
Q9NRN7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
LYS5CGI-80AASD-PPTACPS

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q22.3
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegAASDHPPTpq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:106,075,501–106,098,708
Gene span
23,208 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000278618 ★106,077,662–106,098,6956
ENST00000533423106,075,501–106,091,4594
ENST00000524411106,076,242–106,094,6545
ENST00000926644106,077,591–106,098,7085
ENST00000926645106,077,591–106,098,7085
ENST00001144326106,077,591–106,098,7086
ENST00000878108106,077,662–106,098,7086

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

AASDHPPT 的產物催化受體蛋白的轉譯後修飾:將 CoA 上的 4'-磷酸泛醯巯基轉移至受體蛋白的絲胺酸。此反應可使用游離巯基形式的 CoA,也可使用乙醯硫酯形式的 CoA,因此供體不只限於單一形式。受體範圍廣泛,其中包括 FASN 的 acyl carrier domain。

對 acyl carrier protein(ACP)而言,反應可使 apo-[ACP] 轉為 holo-[ACP],並產生 adenosine 3',5'-bisphosphate 與 H(+)。當供體為 acetyl-CoA 時,產物則為 acetyl-[ACP],同樣伴隨 adenosine 3',5'-bisphosphate 與 H(+) 形成。這兩種反應說明,酵素可利用 CoA 或 acetyl-CoA 作為磷酸泛醯巯基供體,修飾 ACP。

此蛋白亦被記載可結合 1 個 Mg(2+) 離子。現有資料支持其催化轉移反應、受體範圍及金屬離子結合,但未提供更多關於其他生物學過程或下游影響的描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 106077662 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>AASDHPPT ENST00000278618 GRCh38 chr11:106076662-106077762 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CGCGTGGGCTTTCATACGAGAGTCAACAACAGCCTACACGGAACAACTAAGGAAACAGACATACATCAAT
ATGACCCTTCGCAAAGTCTGAGAAAATAACTGAGCAAAGTTATTTACTTGTTTCTGTTGCTGTTAGAGCA
AGGACCTCTGTCATGATGGAAACACTGATACCTCAACAATGGAATCCTGTTTTCTCGCTAGTGCTCTAGC
CCAGGCTTGGCAATAGCAAAACAGCACCTGGGTCGCTTCATCGCCCCAAATAAACAGCCAGCATTAGCTC
AGCTGCTCGCTGGCAGCCTCGGATCCAGGCGGGGTCAGTGTTGCGCACTGGGGATAGTGCCTCTGCTCGG
CCTTCGGAGGGAGGGTTTCAGGTAGGCTGCTGCTAAGGGTCGGGAGCGTACTGTGTGAGGGTGGGTCTTA
GGCTGATGCGGATGGGGGCAGGGAAAGAAGGAACTCAGGGCTGATGCGTTGCACAACTGCAGGGGGCACC
ACTGCAGACCCCCTCCTAGAGATGGAAACCTCTCGTGCCCCGTACACGAAGCAGCTGAAGCCAAGGACAT
TCTCTTCTCTGTGGGTCACAGGGGCCAACTCAGACCCTGAGAATAAGGGCTACCATCCCACTCCTCCCTC
AGACCCCGGAGCTCACCCACCTGCAACTGCAGTCTCCGAAGTCTCCACCCCAGTCTCCCTGCCTCCAGAG
GACTGGTTGCGATTGGCCTGCACCGCTGTCCCGTTAACTCTTCCGCAAGTGTGAGTGGCGTAACTGTCGG
GCTCTTGGCCTTGGTCCCGCCCTTCGCTCGCCTCCGAAGCCTCGCCTACTTGACGTCATACAATGCCGCA
AAGCGCAGGGCTGATCTCCGTCTCCGCCCCCAGCTGCTTTCTCCGAGAGGAGGTGGCTGAGTCGGGGGCG
GGCTGGGAGGGCTGTCGGTGGGCCAGTCTGCGTAGCGACGGCCCGTCCCCTGCGCACGGACGCCGGGAAG
AAGGGGGTGGGGCCACGTTTGCGTCCGCGCCATCAGGCCCGAGATAGCGGCGAGGTCCGCTTTCAGTGTA
TGGTTTTCCCTGCCAAACGGTTCTGCTTGGTGCCATCCATGGAGGGCGTGC
AASDHPPT 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
AASDHPPT_1 ↗11:106,077,662正股106,077,613–106,077,672

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_CDJ7D · enhancer · 106076158–106077336 · regulatory

ENSR11_5WXMRT · CTCF_binding_site · 106077133–106077154 · regulatory

ENSR11_93K4RP · promoter · 106077337–106077672 · regulatory

· motif · 106073887–106073900 · motif

· motif · 106073887–106073900 · motif

· motif · 106076266–106076279 · motif

· motif · 106076266–106076279 · motif

· motif · 106077068–106077078 · motif

· motif · 106077129–106077138 · motif

· motif · 106077129–106077138 · motif

· motif · 106077135–106077151 · motif

· motif · 106077278–106077288 · motif

· motif · 106077479–106077492 · motif

· motif · 106077479–106077492 · motif

· motif · 106077494–106077509 · motif

· motif · 106077522–106077532 · motif

· motif · 106077560–106077573 · motif

· motif · 106077565–106077575 · motif

· motif · 106078318–106078327 · motif

· motif · 106078318–106078327 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:309 aa

AASDHPPT 的蛋白質產物屬於 P-Pant transferase 超級家族,並歸入 AcpS family。來源未提供可供描述的結構域、胺基酸長度或其他序列註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2BYD…

PDB · 2BYD

X-ray · 2.00 A · A=14-309

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytosol

此蛋白質記載位於細胞質與細胞質溶膠。 來源未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
LYS5AASDHPPTCRXEFHC2SIAH1TRAF2USP22
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

此蛋白質以單體形式存在。來源未指出其與其他蛋白質形成複合體或直接結合的夥伴;催化受體蛋白修飾屬功能關係,並不等同於已記載的實體結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能AASDHPPT 催化受體蛋白的轉譯後修飾,將 CoA 所提供的 4'-磷酸泛醯巯基轉移至受體的絲胺酸。供體可以是游離巯基形式的 CoA,也可以是乙醯硫酯形式;受體種類廣泛,包括 FASN 的 acyl carrier domain。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the post-translational modification of target proteins by phosphopantetheine. Can transfer the 4'-phosphopantetheine moiety from coenzyme A, regardless of whether the CoA is presented in the free thiol form or as an acetyl thioester, to a serine residue of a broad range of acceptors including the acyl carrier domain of FASN

PMID 11286508 ↗ · PMID 12815048 ↗ · PMID 18022563 ↗ · PMID 19933275 ↗ · PMID 21238436 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性apo-[ACP] + CoA = holo-[ACP] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

apo-[ACP] + CoA = holo-[ACP] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 12815048 ↗ · PMID 18022563 ↗ · PMID 19933275 ↗ · PMID 21238436 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性apo-[ACP] + acetyl-CoA = acetyl-[ACP] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

apo-[ACP] + acetyl-CoA = acetyl-[ACP] + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 12815048 ↗ · PMID 18022563 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性此蛋白質可結合一個 Mg(2+) 離子;來源未提供結合條件或其功能影響的進一步資訊。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 1 Mg(2+) ion.

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Monomer含實驗來源
證據與來源

Monomer

PMID 12815048 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位此蛋白質的定位記載為細胞質與細胞質溶膠;來源未提供其他定位條件或細胞內位置變化的資訊。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytosol

PMID 12815048 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000278618 · 2,767 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCGTCCGCGCCATCAGGCCCGAGATAGCGGCGAGGTCCGC40
41TTTCAGTGTATGGTTTTCCCTGCCAAACGGTTCTGCTTGG80
81TGCCATCCATGGAGGGCGTGCGCTGGGCCTTTTCCTGCGG120
121CACTTGGCTGCCGAGCCGAGCCGAATGGCTGCTGGCAGTG160
161CGATCGATTCAGCCCGAGGAGAAGGAGCGCATTGGCCAGT200
201TCGTCTTTGCCCGGGACGCTAAGGCAGCCATGGCTGGTCG240
241TCTGATGATAAGGAAATTAGTTGCAGAGAAATTGAATATC280
281CCTTGGAATCATATTCGTTTGCAAAGAACTGCAAAAGGAA320
321AACCAGTTCTTGCAAAGGACTCATCGAATCCTTACCCGAA360
361TTTCAACTTTAACATCTCTCATCAAGGAGACTATGCAGTG400
401CTTGCTGCTGAACCTGAGCTGCAAGTTGGAATTGATATAA440
441TGAAGACTAGTTTTCCAGGTCGTGGTTCAATTCCAGAATT480
481CTTTCATATTATGAAAAGAAAGTTTACCAACAAAGAATGG520
521GAAACAATCAGAAGCTTTAAGGATGAGTGGACTCAGCTGG560
561ATATGTTTTATAGGAATTGGGCACTTAAGGAAAGCTTCAT600
601AAAAGCCATTGGTGTTGGACTAGGATTTGAATTGCAGCGG640
641CTTGAATTTGATCTATCTCCATTAAACTTGGATATAGGCC680
681AAGTTTATAAAGAAACACGTTTATTCCTGGATGGAGAGGA720
721AGAAAAAGAATGGGCATTTGAGGAAAGCAAAATAGATGAG760
761CACCATTTTGTTGCAGTTGCTCTTAGGAAACCCGATGGAT800
801CTAGACATCAGGATGTTCCATCTCAGGATGATTCCAAACC840
841AACCCAGAGGCAATTTACTATTCTCAACTTTAATGATTTA880
881ATGTCATCTGCCGTTCCCATGACACCTGAAGATCCTTCAT920
921TTTGGGACTGTTTTTGCTTCACAGAAGAAATTCCAATACG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。